项目组织的设计问题在项目管理领域没有得到应有的重视,而在组织设计领域也没有特别关注项目组织这一特殊的新型组织模式。这两方面的研究空缺导致了项目组织设计方法落后于项目管理研究领域的整体发展。面对知识经济时代海量的数据信息,面对现代商业环境的快速变化,面对日益庞大的项目规模,传统的组织结构形式及其设计方法显得力不从心。组织权变理论认为没有一致的普遍适用的最优的组织结构和形式,只有在某一具体环境下,适用于其具体条件的最优组织。根据这一观点,项目的组织结构设计应该更加注重项目环境的影响,更加关注组织设计的优化。只有当组织结构与项目环境匹配时,项目组织才能表现出最佳运作。本文从现有的项目组织设计存在的不足出发,确立了运用计算组织理论和现代优化算法来解决项目组织设计问题的主要思想和方法。计算组织理论是采用计算和数学手段来研究人类组织的理论。应用这一理论的首要工作是组织建模。本文根据项目这一特殊组织的特点对项目组织进行了分层描述和实体建模,包括状态模型、结构模型和转移方程,并讨论了项目组织的重构触发条件。接下来,提出了项目组织的适应性设计方法,分为目标规划和组织结构设计两个阶段。然而,项目组织设计模型的求解工作却是一项复杂的系统工程。简单的数学优化算法可以求解出规模小、环境稳定的项目的组织结构设计,但对于规模庞大、规划目标众多、资源限制较多的复杂项目而言,一般的优化算法很难求解出满意解。现代优化算法是求解复杂优化问题的有效工具,项目组织设计的最终求解就是使用了遗传优化算法、改进的多维动态列表规划和组织决策树生成算法等三种优化算法来求得满意解。最后的案例分析验证了该方法的有效性。