十二株放线菌系统发育的研究

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本实验主要对12株分离自承德、云南及保定等不同环境的土壤样品的放线菌,进行了系统发育的研究。本文综述了放线菌作为生物资源,在研究与开发方面的重要价值,介绍了目前放线菌的分类研究进展和发展趋势,同时介绍了当前放线菌系统发育研究所采用的分类技术的应用及研究进展。本实验对12株放线菌进行了形态特征及生理生化特性的研究。形态学的研究观察了Bennett等四种培养基上的培养特征,采用平皿插片法进行菌体形态特征的观察。在生理生化实验中进行了碳源利用、硝酸盐还原、酶类产生、抗生素敏感、蛋白类有机复合物降解、H2S产生及NaCl耐受性等实验。12株放线菌的DNA G+C mol%在70.74%~75.22%之间,属于高DNA G+C mol%的范围,与已知放线菌的DNAG+C mol%范围是相同的。实验获得了12株放线菌16S rDNA的近乎全序列,将其与GenBank中已知序列进行比较,可将这12株放线菌划分为4个类群:菌株79064与线团拟诺卡氏菌(Nocardiopsis synnemataformans)关系最近,16S rDNA序列相似性为98.51%;菌株84169与小单孢菌属(Micromonospora)关系最近,但16S rDNA序列相似性最高的也只有94.22%;菌株87063与游动放线菌属(Actinoplanes)的种关系最近,16S rDNA序列相似性最高为96.45%。菌株71413等9株菌与链霉菌属(Streptomyces)的菌株进化关系最近,其中,菌株71413与Streptomyces ciscaucasicus16S rDNA序列相似性为99.77%;菌株84016与公牛链霉菌(Streptomyces tauricus)关系最近,16S rDNA序列相似性达到100%。与菌株84717关系最近的是Streptomyces ciscaucasicus和Streptomyces canus,16S rDNA序列相似性都为97.52%;菌株81113与黄色长孢链霉菌(Streptomyces longisporoflavus)的16S rDNA序列相似性是98.84%;菌株AH-31-13与Streptomyces werraensis的16S rDNA序列相似性是97.99%;与菌株78524关系最近的是Streptomyces xantholiticus和Streptomyces graminofaciens,16S rDNA序列相似性都为99.00%;菌株83957与公牛链霉菌(Streptomyces tauricus)的16S rDNA序列相似性97.26%;菌株84254与白长链霉菌(Streptomyces albolongus)的16S rDNA序列相似性97.52%;与菌株74842关系最近的是公牛链霉菌(Streptomyces tauricus),16S rDNA序列相似性97.05%。通过以上系统发育关系的研究,确定了12株放线菌的系统发育地位。菌株79064属于拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis);菌株71413、84016、84717、81113、AH-31-13、78524、83957、84254、74842,应归属于链霉菌属(Streptomyces)。菌株84169与小单孢菌属(Micromonospora)的系统进化关系最近,但16S rDNA序列相似性低于95.00%,应属于1个属一级的新分类单元;菌株87063与游动放线菌属(Actinoplanes)的种关系最近,但16S rDNA序列相似性低于97.00%,应属于1个种一级的新分类单元。
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