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八角莲属(Dysosma) (小檗科)包括七个中国特有的多年生草本植物物种,其根状茎是传统中草药“鬼臼”的来源,具有重要的保护遗传学研究价值。前人对八角莲、六角莲、川八角莲的繁育系统和/或遗传多样性及八角莲属内系统发育进行了较深入的研究,但对整个八角莲属的遗传多样性、遗传结构、基因流、居群动态历史等保护遗传学的研究却由于缺乏属内通用的共显性分子标记而滞后。本研究从八角莲转录组中开发了18个具有多态性且在属内通用的EST-SSR,选择高多态性、低无效等位基因的15个位点用于该属的保护遗传学研究。本研究的主要结果如下：(1)尽管形态学观察表明西藏八角莲和云南八角莲的繁育系统为异交,但本研究发现其居群为近交居群(云南八角莲：FIS=0.400/0.657；西藏八角莲：FIS=0.408/0.263),可能是由两个物种的居群过小导致的或者当前的交配系统已从异交进化为自交。此外,本研究从分子水平证明川八角莲交配系统为自交,而小八角莲、八角莲和六角莲则原本为异交物种,由于分株间的有性繁殖,部分居群变为近交居群。(2)遗传多样性分析表明,八角莲属物种具有低的期望杂合度[从0.058/0.044(云南八角莲)至0.448/0.464(小八角莲)]。且AMOVA和阶层AMOVA显示,八角莲、六角莲、川八角莲和小八角莲的物种/支系内居群间有较高的遗传分化程度(分别为0.469/0.458；0.330/0.262；0.424/0.386；0.629/0.666)。上述结果表明该属植物的遗传多样性和遗传分化受到了生境片断化导致的瓶颈的影响。(3)八角莲、六角莲、小八角莲和贵州八角莲四个近缘种的遗传结构分析结果表明,六角莲、小八角莲和贵州八角莲已独立成种,八角莲分为三个支系,这三个支系的分类地位与本属种的地位相当。物种/支系内遗传结构分析表明,八角莲各支系、六角莲、小八角莲、贵州八角莲、川八角莲等共有18个ESUs。(4) Mantel test 和 Partial mantel test表明,六角莲、八角莲南部支系、川八角莲的物种/支系内居群间的分化是由地理隔离(IBD)和/或环境隔离(IBE)导致的。(5)当代和历史基因流及居群动态历史研究表明,气候波动(更新世后期：10,000至100,000年前)和人类活动(7000年前至今)共同导致了居群的片断化,促进了居群间的基因流隔离。根据上述结果,我们提出以下八角莲属保护策略：对八角莲属物种/支系内共20个ESU[18+1(云南八角莲)+1(西藏八角莲)]进行独立迁地保护,选择各ESU中有效居群大小较大且遗传多样性较高的居群进行优先就地保护并选择处于不同环境梯度下的居群进行独立保护。