太湖是中国第三大淡水湖，位于长江三角洲，平均水深1.9米，面积达2338平方米。它为周边的38个城市超过1000万人提供饮用水。然而富营养化导致太湖水华时常发生，生态系统发生退化。太湖水华主要由微囊藻构成，其中部分微囊藻可以产生毒素。在本研究中，作者分析了2008年到2009年太湖微囊藻gvpAC-IGS(基因间序列)基因型的演替并分离得到各gvpAC-IGS类型的微囊藻藻株;作者对多个藻株的生长特性进行了研究，结果表明秋季太湖产毒微囊藻比例的增加是由不同微囊藻温度适应性存在差异所导致，而不是由不同微囊藻产毒性存在差异所导致。　　本研究的主要研究结果如下:　　(1)通过构建微囊藻gvpAC-IGS克隆文库并随机挑选一定数量的克隆进行测序，研究了2008年11月至2009年12月期间太湖微囊藻基因型的演替。太湖微囊藻样品中至少存在21种gvpAC-IGS类型。在2008年11月到2009年8月期间，gvpAC-IGS类型1是太湖微囊藻的主要类型，进入2009年9月后，类型1的比例开始下降，到了2009年10月已经检测不到类型1，进入2009年11月后类型1的比例开始回升，到了2009年12月类型1再次成为主要类型。在2008年11月到2009年12月期间均可检测到类型2，其比例变化很小。在2009年9月至2009年11月期间很少发现类型3、4和5但经常可以发现类型6-11和类型17-21。　　(2)通过荧光定量PCR研究了太湖产毒微囊藻占总微囊藻比例的变动。太湖产毒微囊藻的比例在0.1％到29.44％之间变化。进入2009年9月后，太湖产毒微囊藻比例显著升高，并在2009年10月达到顶峰，到了2009年11月产毒微囊藻比例开始下降并在2009年12月降低到本底水平。　　(3)从太湖水华样品中成功分离得到18种gvpAC-IGS类型的微囊藻。作者从太湖水华样品中成功分离得到58株微囊藻，囊括了太湖已知21种gvpAC-IGS类型中的18种。通过PCR和HPLC分别检测了这些藻株的mcyA/mcyB基因和微囊藻毒素LR/RR的含量，结果显示类型6、8、15、17、19和20为产毒类型，剩下的类型为非产毒类型。在以16S rDNA序列构建的NJ树中，这些藻株均聚类在微囊藻分支上。　　(4)对4株典型微囊藻的温度适应性进行了研究。当在低N/P BG11培养基中培养时，高温条件下(30、25℃)类型1的比生长速率及光合放氧速率较类型6、9、10低，而在低温条件下(20、15℃)类型1的比生长速率及光合放氧速率较类型6、9、10高。高温条件下(30、25℃)经过4轮共培养，类型1与竞争藻的比显著降低，而在低温条件下(20、15℃)经过4轮共培养，类型1与竞争藻的比显著升高。　　除研究了太湖微囊藻基因型演替外，作者还对70多株分离自中国不同省份的微囊藻的gvpAC-IGS进行了测序，研究了这些微囊藻的系统发生关系。