多聚腺苷酸与信使RNA (mRNA)分子的共价链结称之为多聚腺苷化(poly(A))。 Poly(A)尾巴是以无模板的方式添加到mRNA上的腺苷酸链,它是真核生物mRNA的重要结构特点,对真核生物基因表达具有重要意义。众多研究表明真核生物基因中广泛存在mRNA选择性多聚腺苷化(alternative polyadenylation, APA)位点,它在基因表达阶段起重要的调控作用。分析不同类型的APA位点及其表达差异,将有利于深入理解基因表达调控,促进调控真核生物mRNA多聚腺苷化过程的分子、生物及进化机制的研究。高通量数据分析作为目前研究植物多聚腺苷化的一个重要手段,其位点比较分析是探究植物等生物基因表达的关键。随着下一代测序技术的发展,常规测序实验都会产生数以百万计的测序数据,生物学家能获得来自不同条件下的更多数目的poly(A)位点数据。因此,这迫切需要开发一个用户界面友好、高效的工具来可视化大量的poly(A)位点数据,辅助生物学家进行APA分析。然而,目前并没有专门用于APA研究,且提供基于poly(A)位点的分析可视化在线平台。为了满足这一需求,本文开发一套可视化的选择性多聚腺苷化在线分析Web平台。平台主界面是基于Linux、 Apache、 MySQL和PHP构建的,为分析可视化平台提供界面入口、操作说明和数据上传服务：分析可视化平台则基于GWT (Google Web Toolkit),使用Java作为开发语言,采用多层架构,结合Spring、 Hibernate的lava Web开源框架,应用MVP (Model-View-Presenter)设计模式实现开发。平台以拟南芥不同组织和水稻根组织的poly(A)数据为输入,综合分析了多种条件下poly(A)位点分布情况以及APA组织和物种的特异性,目的是为了辅助生物研究人员进行实验分析,促进植物位点分析与识别研究的发展。