基于UMLS的药物知识组织模型研究

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在知识经济时代,知识组织已成为各领域重点关注的对象。数据本身并不能创造太多的价值,对于数据的分析利用,从中提取知识,最终组织成为知识网络才能为个人、群体创造巨大的价值。现代医学发展迅速,医学领域知识增长更新的速度加快。在生物医学领域,药物研究一直是重点关注对象。药物与疾病、症状、生物工程等研究息息相关,对于药物知识组织的研究,能够有效整合现有的药物知识,发掘药物与其他知识间的潜在联系,辅助医药研发等提供更多有用的知识。UMLS是生物医学领域的一体化知识组织体系,该体系中包含了超级叙词表、专家词典以及语义网络,这三大模块能够对医学领域知识专业、规范化描述,根据UMLS抽取的知识单元表述规范、逻辑正确,且语义网络的知识组织方式更能够适应万维网发展的信息大环境。关联数据于2006年被首次提出后,作为语义网的最佳实践受到广泛的关注,在历经数十年的研究与发展,其理论成果较为丰富,应用实践的领域也越来越广。医药数据庞大且复杂,数据类型丰富、结构各异、形式多样,为了更好的管理医药领域的资源,有效完成知识组织的任务,利用UMLS以及关联数据技术进行医药知识组织是具有较大优势的。这种方式不仅能够提高医药数据管理的效率,提高知识组织的质量,也能够促进医药研发工作的发展与医学事业的进步,提高医疗领域的服务水平。本文引入UMLS和关联数据技术对药物知识组织方法以及药物知识组织模型构建进行深入研究。首先调研知识组织在医学领域的应用以及药物知识组织的研究现状,把握最新研究动态,提出了基于UMLS的药物知识组织研究方法。其次本文对药物知识的内涵、知识组织的相关技术方法以及UMLS的基础概念进行论述,分析了语义网环境下知识组织模式,这是构建基于UMLS的药物知识组织模型的重要理论基础。然后设计基于UMLS的药物知识组织体系结构,提出基于UMLS的药物知识组织方法,对UMLS的词汇工具、知识元获取方式以及语义推理三个技术方法进行深入探讨:接着复用现有的成熟药物本体,利用元数据技术对药物知识进行语义描述,依据本体构建七步法构建药物本体;并设计基于关联数据的药物知识集发布流程:实现动态维护药物知识集内部关联以及药物知识集与外部知识集之间的关联。最后构建基于UMLS的药物知识组织模型,阐述模型设计的思想和目标,分析模型中各层次模块的功能,并分析基于UMLS的药物知识组织的优势。同时以LODD项目为案例,验证模型的可行性和实用性。结果表明将UMLS与关联数据技术应用在药物知识组织中是一种有效整合药物知识、深度组织药物知识以及实现药物知识共享的方法和途径。
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