突如其来的新冠肺炎疫情给我国人民的生命安全与经济活动带来了巨大的影响,供应链作为经济活动的重要组成部分,同样不可避免地遭受了冲击,如何应对供应链中断成为了现在企业面临的重要课题。供应链本质是一个复杂的系统,一个完整的供应链包括供给、运输、存储和销售等多个环节,任何一个环节出现问题都会造成整条供应链中断。因此,本文先分别考虑供给和运输环节,构建突发疫情下供应链中断的协调策略模型,然后综合考虑供给和运输环节构建供应链协调模型并对模型的计算结果进行对比分析。首先考虑供给环节构建突发疫情下供应链中断协调模型。保证突发疫情下制造商有充足的供应是减小供应链中断损失的重要措施,本文构建不同情形下由低价不可靠的主供应商、高价可靠的后备供应商和风险规避的制造商组成的二级供应链系统,研究制造商和后备供应商签订期权契约协调中断下的供应链系统。通过数值仿真得出以下结论:（1）市场需求和主供应商的采购价格都是影响疫情下制造商最优采购量的重要影响因素,当疫情导致主供应商出现供应中断时,其剩余的交货比例也成为了影响制造商采购的因素。（2）当市场需求,主供应商的剩余交货比例和制造商的采购成本等影响因素变化时,制造商的最优采购决策和应急策略的选择都将发生变化。（3）当且仅当主供应商的供应价格小于制造商向市场销售该产品销售价格和自身制造成本之差时,制造商的最优采购量随着期权执行价格增加而增加。然后考虑运输环节构建突发疫情下供应链中断的协调模型。运输过程中的过度损耗会扩大供应链中断损失,所以为了提高供应链运输质量,减小运输过程中的损耗,供应链上成员会选择引入专业的第三方物流企业（TPL）承担供应链的运输或其他物流增值服务。本文研究由供应商、TPL和制造商组成的三级供应链系统。分别引入中断惩罚契约和成本共担契约协调中断下的供应链系统。通过数值仿真得出以下结论:（1）引入中断惩罚契约和成本共担契约后的供应链系统整体期望利润大于传统分散决策下的整体期望利润。（2）中断惩罚契约模式下,中断惩罚成本越大,制造商最优采购量、TPL最优物流服务水平和供应链整体的期望利润都逐渐增加;成本共担契约模式下,制造商承担的物流服务成本比例越大,制造商最优采购量和供应链整体期望利润都逐渐减小,TPL的最优物流服务水平保持不变。（3）当中断惩罚契约模式下中断惩罚成本满足一定条件时,中断惩罚契约对供应链的协调效果优于成本共担契约。最后,同时考虑供给和运输环节构建突发疫情下供应链中断的协调模型。前两个部分分别考虑单一环节协调中断后的供应链系统,本部分结合供给和运输环节的协调策略,构建同时存在后备供应商和TPL的供应链系统,分别计算传统分散决策模式和引入中断惩罚契约的分散决策模式下制造商的最优采购决策和供应链整体的期望利润。通过对比分析得出以下结论:（1）传统分散决策模式下同时存在后备供应商和TPL的供应链系统中制造商的销售量和TPL的物流服务水平都大于仅存在TPL的供应链系统,但对应的制造商利润和供应链整体的期望利润却取决于物流服务水平的比例关系。（2）引入中断惩罚契约的分散决策模式下,同时存在后备供应商和TPL的供应链系统与仅存在TPL的供应链系统的变化关系,与传统分散决策下基本相同。（3）引入中断惩罚契约的分散决策模式下,同时存在后备供应商和TPL的供应链系统中,制造商向后备供应商的紧急采购量与仅存在后备供应商的供应链系统中制造商的紧急采购量之间的关系,取决于制造商向主供应商的最优采购量的大小。