本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛HSP70基因5’-侧翼区PCR-SSCP分析，发现HSP70基因5’-侧翼区基因序列的多态性，采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析，并对突变产生的影响进行预测。同时结合HSP70基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据，分析荷斯坦奶牛HSP70基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70基因5-侧翼区PCR-SSCP分析 根据NCBI上已登录的HsP70基因5’-侧翼区序列设计四对引物，扩增出HSP70基因5’-侧翼区。采用SSCP方法分析所得到序列在个体间的多态性，将得到的多态进行测序分析，并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现：在HSP70基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的4个突变位点，分别为第602位点T缺失，第691位点A突变为C，第1220、1309位点A突变为G。通过Matinspector软件对启动子序列进行分析，发现多个HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC元件、TATA盒、CAAT盒、八聚体框)。其中第691位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内，可能对HSP70的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析，发现荷斯坦奶牛P2和P4序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(P>0.05)。P2处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著，但AB型有比BB型低的趋势。推测A基因可能是耐热基因，B基因可能是非耐热基因。