通过沉默DNMTs研究胃癌中RPRMDNA甲基化与基因表达的关系

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DNA甲基化是主要的表观遗传修饰之一,DNA异常甲基化导致疾病甚至是癌症的发生。因此对癌基因组学和表观遗传学的综合研究,是癌症相关机制研究的必然趋势。已有报道称在多种恶性肿瘤包括胃癌中都检测到RPRM启动子甲基化,而在胃癌血浆样本中也频繁检测到RPRM启动子甲基化。因此RPRM有可能成为早期胃癌检测的标志分子。另外,RPRM的功能我们还不是特别了解,而有报道称DNA甲基化是调控RPRM表达的可能机制。本课题在先前工作的基础上,优化了亚硫酸氢钠转化方法,并建立了完整的RPRM启动子甲基化检测方法。同时利用RT-PCR和qRT-PCR的方法检测了在不同样本中RPRM的mRNA表达情况。经过甲基化测序后的结果表明,相对于正常个体,胃癌病人的组织和血浆中都有着较高程度的RPRM启动子甲基化。与此同时,RPRM启动子甲基化程度高的样本RPRM不表达或者低表达,而甲基化程度低或者未检测到甲基化的的样本则有较高的RPRM表达。因此,实验结果表明RPRM启动子甲基化在胃癌中有着较高的特异性,RPRM的表达受DNA甲基化的调控。在确认了RPRM的表达受DNA甲基化的调控之后,运用去甲基化小分子药物也就是 DNMT(DNA methyltransferase)抑制剂 zebularine 处理 AGS 和 SGC-7901两种胃癌细胞系,以此来反向验证RPRM表达与DNA甲基化的关系,并了解zebularine对胃癌细胞的影响以及它对RPRM表达的影响。结果表明AGS和SGC-7901两种细胞系在一定浓度和时间的zebularine处理下,其RPRM启动子的甲基化程度明显降低,RPRM的表达显著提高。而zebularine不能抑制所有的DNA甲基转移酶,因此利用RNA干扰技术沉默了 DNMT1,D DNMT3A和DNMT3B来探究RPRM的表达情况与DNA甲基转移酶的相关性。研究发现,各种DNA甲基转移酶的低表达可以增强RPRM在AGS和SGC-7901两个细胞系中的表达,尤其是,DNMT3B表达的缺失会导致RPRM的高表达。
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