目的:应用下一代测序（NGS）技术对晚期鳞状细胞肺癌的分子分型进行统计分析,并结合患者的基本特征及临床资料指导治疗,并对治疗效果进行回顾性分析,以探讨晚期鳞状细胞肺癌基于NGS技术临床应用的可行性。方法:收集自2019年1月-2021年6月就诊于南昌大学第一附属医院经筛查后的125例符合入组要求的晚期鳞状细胞肺癌患者进行NGS检测（通过收集患者肿瘤新鲜组织、福尔马林固定石蜡包埋、血液、胸水和白片等标本）,并进行统计及随访。通过确定其分子分型,将10例EGFR突变患者及2例ALK融合患者进行治疗,并结合临床资料及疗效对其进行回顾性分析。应用SPSS26.0统计软件和Graph Pad Prism 9.0进行统计分析和制图,生存时间采用Kaplan-Meier法,应用log-rank法检验生存差异。结果:1、105例突变患者中,共检出突变基因16个,突变位点150个;平均每个患者检出1.43个基因突变。突变率较高的基因为TP53（65%）,范围在4-10外显子。所有基因突变中包括单基因突变69个,双基因突变20个,三个及以上基因突变13个。与临床靶向药物获益的相关驱动基因包括EGFR突变位点11个,包括18-21外显子突变,主要以21外显子L858R突变及19外显子L747缺失为主;ALK融合2个;ERBB2 20外显子突变1个。临床靶向药物获益的相关驱动基因突变概率为:EGFR（78.6%）,ALK（14.3%）,ERBB2（7.1%）。相关驱动基因突变病例数占总病例数比例为:EGFR（8.8%）,ALK（1.6%）,ERBB2（0.8%）。收集125例患者的病理样本种类并分析各样本的基因突变例数,其中:白片4例,胸水1例,血液18例,组织/蜡块82例。经统计学分析,P=0.000,鳞状细胞肺癌突变与样本类型差异有统计学意义。以组织及蜡块组为金标准,分别对比白片-组织/蜡块,胸水-组织/蜡块,血液-组织/蜡块组间差异。其中,白片-组织/蜡块组（P=1.000）,胸水-组织/蜡块组（P=0.187）差异无统计学意义,血液-组织/蜡块组（（?）~2=15.680,P=0.000）差异有统计学意义。3、13例与靶向药物获益的相关驱动基因患者中,年龄、骨转移组P＞0.05,差异无统计学意义;男性患者药物相关基因突变的概率为5.3%,女性患者药物相关基因突变的概率为63.6%,P=0.000,差异有统计学意义;有吸烟史患者药物相关基因突变的概率为3.7%,无吸烟史患者药物相关基因突变的概率为22.2%,P=0.002,差异有统计学意义。4、根据服用靶向药的情况,将10例EGFR基因突变患者分为一、二代EGFR-TKI治疗组（7例）及三代EGFR-TKI组（3例）,并绘制生存曲线。Log-Rank检验结果所示,一、二代EGFR-TKI组对比三代EGFR-TKI组的中位PFS有统计学差异（9个月vs 13个月,P=0.037＜0.05）。5、在7例服用一、二代EGFR-TKI的患者中,有4例患者是仅有EGFR突变,而另外三例患者合并TP53突变及EGFR扩增。以驱动基因将其分为EGFR单基因突变组和EGFR共突变组,并绘制生存曲线。Log-Rank检验结果所示,EGFR单基因突变组和EGFR共突变组的中位PFS无统计学意义（9个月vs 7个月,P=0.524＞0.05）。6、在12例经靶向治疗的患者中,因疾病进展及耐药的发生,2名患者又一次行NGS检测。患者1服用吉非替尼耐药后行NGS检测后发现EGFR突变频率较前升高,改口服奥希替尼单药治疗后疗效评价为PR,靶病灶直径较前缩小51.7%,后因肺癌上腔静脉阻塞综合征死亡。患者2服用阿法替尼耐药后行NGS检测后发现EGFR突变频率较前大幅下降,仅为0.11%,而第一次检测到的TP53基因消失。考虑到EGFR突变频率低,治疗方案改为TP联合阿美替尼靶向治疗。目前仍处于治疗期间未到评估时间。结论:1、在晚期鳞状细胞肺癌的人群中,≥65岁,既往有吸烟史,无骨转移的男性较为多见。2、晚期鳞状细胞肺癌基因突变多发生于无骨转移的患者,而靶向药物获益的基因突变多发生于女性及无吸烟史的患者。3、组织/蜡块标本比血液标本检出基因突变概率更高。4、对于EGFR突变的晚期鳞状细胞肺癌患者,三代EGFR-TKI比一、二代EGFR-TKI有着更长的PFS。5、NGS可动态检测基因突变及频率的变化。