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三代虫是危害金鱼(Carassius auratus (L.))的主要寄生虫病原之一,我国报道的金鱼寄生三代虫的种类与国外存在很大差异。为查明我国金鱼寄生三代虫的种类及感染情况,于2012年5-7月,对我国6个金鱼主要养殖区(郑州市、南京市、武汉市、广州市、上海市、海口市)进行了调查。采用形态学与分子生物学相结合的方法鉴定了三代虫的种类,并用核糖体基因转录间隔区(ITS)序列分析了三代虫的系统分类地位和种间亲缘关系。主要研究结果如下：1我国的金鱼上大概寄生4种三代虫,分别为：小林三代虫(Gyrodactylus kobayashii)、 G. gurleyi、G. longoacuminatus以及G.sp.。本研究描述了它们的主要形态特征,并测定和提交了小林三代虫、G. gurleyi和G. longoacuminatus的ITS序列,GenBank登录号分别为KC922452、KC922453和KC922451。通过分析,小林三代虫、G. longoacuminatus和G.sp.的种内变异在1%以内,G. gurleyi的种内变异最高为1.8%,4种三代虫种间变异较大,最低为15.1%。2G. gurleyi和G. longoacuminatus为中国三代虫新纪录种,小林三代虫和G. gurleyi为金鱼常见寄生三代虫,与以往国内对金鱼三代虫常见种(中型三代虫(G. medius)、细锚三代虫(G. sprostonae)和秀丽三代虫(G. elegans))的报道存在很大差异,与国外研究较为一致。小林三代虫存在于所有采样点,并且在广州、武汉、郑州三个采样点为优势种,所占的比例都在60%以上G. gurleyi在除郑州外的其它5个地区都被发现,而且在海南、南京和上海为优势种,所占的比例都在50%以上；G. longoacuminatus和G. sp.两种三代虫所占比例均较小。3调查发现,我国5个金鱼主要养殖区的三代虫(不分种类)感染率都较高,南京最低,为70%,上海和海南高达100%；感染强度和平均丰度也均较高,平均丰度最低的是上海,最高的是郑州,分别为26.6条和102.1条。4采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯法,分别构建了上述4种三代虫与其他23个相近种之间的系统进化树,三种系统发育树显示,4种三代虫均隶属于Limnonephrotus亚属,与Gyrodactylus亚属的秀丽三代虫的亲缘关系较远。结合秀丽三代虫对欧鳊属(Abramis)鱼类很强的寄主特异性,本文推断以往国内对寄生于金鱼的三代虫主要是秀丽三代虫的报道是不准确的。