改革开放以来,我国民办高等教育事业发展迅猛,但其经费来源结构始终比较单一,致使其发展速度以及规模一直都比较有限。相比之下,日本民办高等教育的经费来源结构多元且比例均衡,可为我国民办高等教育经费筹措提供有益借鉴。基于此,本论文对中日两国民办高等教育经费来源结构进行了比较研究。研究发现:中日两国民办高等教育的经费来源大体一致,包括学杂费收入、银行贷款,社会捐赠、科研及校办产业收入以及政府财政资助等等。但相比之下,我国民办高校的学杂费收入占比过高,接近其总办学经费的九成,其他收入来源较少。例如,政府资助较薄弱（甚至多数民办高校完全得不到政府资助）,社会捐赠数额较少,银行贷款较难,校办产业也受限于科研创新能力而不发达等,这就使得我国民办高等教育的经费来源结构不够多元化;而日本民办高校的学费收入虽然也是其重要的经费来源,约占其总经费的三分之二,但其他方面的收入较我国更高。由此可见,中日两国民办高等教育的经费来源的渠道虽然相似,但是各个渠道所获得的办学经费比例有很大差异,我国民办高校的筹资面临着“渠多水少”甚至“有渠无水”的现状。从成因看,导致我国民办高等教育经费来源单一的原因是多方面的,既有来自政府和社会的外部原因,例如财政资助政策落实不力,缺乏贷款担保机制,获贷渠道单一,社会歧视与偏见等,也有来自民办高等教育办学水平不足的自身原因,例如毕业生发展前景有限而影响校友及社会捐赠,教学科研能力不高而使得校办产业缺乏核心竞争力,办学水平不高而影响社会声誉,等等。基于此,今后要促进我国民办高等教育筹资结构的多元化发展,可考虑从如下几个角度考虑:首先是需要政府可以考虑加大对民办高校的资金支持以及优惠政策的落实力度,其次,建立起有中国特色的民办高校获贷的风险担保机制以拓展其获贷渠道,再次,完善并落实民办高校的贷款及税收优惠政策,最后,我国民办高校自身也应该加强与银行的合作,提升科研能力及办学水平以提升社会声誉度,这样才能使自身的办学经费来源结构更多元化。我国的民办高等教育事业要得到长远的健康发展,必须靠我国政府和民办高校双方一起共同努力。