【摘 要】
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背景:肿瘤微环境(TME)在不同类型的癌症的发展中起着重要作用。然而,与肝细胞癌(HCC)相关的TME的关键调控基因仍不清楚。在这项研究中,我们进行了基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)的生物信息学分析,并使用Estimation of STromal and Immune cells in Malignant Tumor tissues using Expression
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背景:肿瘤微环境(TME)在不同类型的癌症的发展中起着重要作用。然而,与肝细胞癌(HCC)相关的TME的关键调控基因仍不清楚。在这项研究中,我们进行了基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)的生物信息学分析,并使用Estimation of STromal and Immune cells in Malignant Tumor tissues using Expression data(ESTIMATE)数据集估算了恶性肿瘤组织中的基质细胞和免疫细胞,以预测影响肝癌肿瘤微环境的关键基因。资料和方法:首先,过滤并合并具有ESTIMATE评分的340例患者和20531个基因的表达数据,以鉴定差异表达的基因。接下来,进行蛋白互作网络(PPI)和功能富集分析以发现关键基因。然后,对关键基因进行了log-rank检验和功能富集分析。最后,绘制了关键基因的Kaplan-Meier曲线。结果:在所有差异表达的基因中,免疫和基质组均表达的有916个基因。这些基因所在的最重要的基因本体论(GO)富集功能是T细胞活化,白细胞迁移,含胶原基质,质膜外侧,受体配体和活化剂活性。最重要的京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路是细胞因子与细胞因子受体的相互作用。此外,cd3e,cd3g,hla-dpa1,hla-dpb1,lck和map4k1基因为关键基因,在304例患者中低表达,他们参与多种应答,包括免疫应答激活细胞表面受体信号传导,免疫应答激活信号传导,网格蛋白包被的囊泡膜,免疫受体活性和肽/酰胺结合途径。作为验证,我们在Oncomine数据库上搜索了这些基因,证实了它们在肝细胞癌中的低表达状态。结论:cd3e,cd3g,hla-dpa1,hla-dpb1,lck和map4k1与原发性肝细胞癌的免疫微环境显著相关,他们在癌细胞内的低表达可能预示较差的5年生存率,可作为判断肝癌预后的关键因素。
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目的:FAM216A作为FAM216家族的一员,既往研究结果表明,FAM216A表达与肝细胞癌患者的无病生存密切相关,通过检索在线数据库,我们可以发现FAM216A在多种人类癌症组织类型中都具有明显升高的表达水平,并且在肾癌和肝细胞癌中FAM216A过度表达与患者生存率降低密切相关。由于FAM216A在非小细胞肺癌(NSCLC)里所起的临床机制和意义距今为止还没有探究明白,在NSCLC中所起的作用
本文基于对习近平总书记关于办公厅(室)工作系列重要论述的学习,总结论述主要内容、丰富内涵以及学习体会,并探索分析重要论述对高校办公室建设的指导作用。
目的:膜联蛋白A11(ANXA11)位于人类染色体10q22-q23上,属于annexin A家族,与多种疾病相关,目前尚无ANXA11在非小细胞肺癌(NSCLC)中的相关报道,因此探讨ANXA11在非小细胞肺癌中的表达状况以及不同的临床病理特征间的关系,为ANXA11在NSCLC中的发展以及机制的研究奠定基础。研究方法:收集中国医科大学附属第一医院病理科2018年6月至2019年6月115例NS
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