论文部分内容阅读
本实验以台湾褐色菜鸭为试验材料,通过PCR-SSCP和测序技术对台湾褐色菜FSHβ基因进行SNP检测同时分析其多态性与各性状的关联；通过实时荧光定量PCR技术,通过使用2-△△ct换算法对FFSHβ基因拷贝数进行定量,并分析其多态性与生产性能的关联。(1)在台湾褐色菜鸭FSHβ基因扩增序列的第106bp、第266bp和第267bp位点发现碱基替换(分别为A106C.C266T和A267G),并产生了HH、Hh和hh三种基因型,其中HH型为野生型,共有7个个体,Hh型共有46个个体,hh型共有41个个体；h等位基因频率是0.6809,H等位基因频率是0.3191；该基因座位的杂合度为0.4346；其多态信息含量为0.3401；FSHβ基因多态位点经χ2适应性检验表明处于平衡状态。经关联发现,基因型Hh和基因型hh的个体的四周龄体重均显著低于基因型HH的个体(P<0.05)；基因型Hh和基因型hh的个体的蛋重均显著高于基因型HH的个体(P<0.05)；基因型Hh的个体蛋壳厚度极显著低于基因型HH的个体(P<0.01),同时基因型hh的个体也显著低于基因型HH的个体(P<0.05)。(2)将FFSHβ-F/FSHβ-R和|Anpl-DRA-F-F/Anpl-DRA-两对引物进行定量PCR的扩增,应用荧光定量PCR仪自带系统,绘制标准曲线。FSHβ基因引物的曲线相关系数R2=0.996,扩增效率E=108.337%,斜率为-3.137；Anpl-DRA基因引物的曲线相关系数R2=0.990,扩增效率E=106.068%,斜率为-3.185。其中斜率差为0.048,扩增效率差为2.269%。(3)本试验利用荧光定量PCR技术检测鸭FSHβ基因拷贝数变异情况,共检测五种变异类型,个体数分别为42、26、15、7、4。关联分析显示,台湾褐色菜鸭FSHβ基因CNVs位点的五种拷贝数变异与其蛋壳厚度和蛋白高度均存在显著相关(P<0.05),在蛋壳厚度中五种拷贝数变异存在两两显著差异,其中拷贝数为1的个体蛋壳厚度极显著高于拷贝数为2的个体；拷贝数为Ⅳ的个体蛋白高度明显低于拷贝数为Ⅰ、Ⅱ、和Ⅲ的个体；其余性各状间均无显著相关(P>0.05)。