金融是一个国家现代经济的核心，而银行作为金融的主体组成部分，对国家经济稳定和金融安全至关重要。商业银行一方面要不断进行金融产品创新以应对激烈的市场竞争，同时要进行商业银行不断进行金融产品创新并提供更多、更好的的产品，以不断提升其服务水平。面对日益复杂的经济环境，更为激烈的市场竞争，商业银行持续进行金融创新、打造更为丰富的产品，但随之而来组织机构扩大，管理层级增加，管理链条更长，商业银行的经营压力更大和风险控制要求更高，进一步提高内部控制水平，有效化解经营风险成为商业银行的必然选择。以国有商业银行为标志的金融改革，大大推进了国有商业银行内部控制的进程。中国商业银行的公司治理和内部控制开始晚，虽然经过快速的发展，但是在很多方面需要进一步完善。本文以农业银行新疆兵团分行为实例，从内部控制的几个方面要素进行比较分析，发现其内部控制管理方面存在的问题和要解决的困难，结合目前农业银行新疆兵团的现状，根据内部控制管理的理论研究，从内部控制体系设计、制度建设、工具使用等方面提出如何加强农业银行新疆兵团内部控制建设的建议。本文力求通过对农业银行新疆兵团分行内部控制的分析和思考，为商业银行的内部控制建设提供有益的参考。