“十一五”规划以来,随着主体功能区规划的推进,区域金融发展的作用更加受到学者们的重视。在主体功能区建设中区域金融发展不仅具有综合性经济增长功能,而且在化解资源环境瓶颈、调整产业结构、推进基础设施建设、维护和修复生态等方面发挥着重大作用。同时,区域金融发展与主体功能区经济增长之间存在怎样的关系,这也引起一些学者的关注。因此,本文就新疆主体功能区金融发展与经济增长的关系展开讨论。本研究以金融发展理论作为分析新疆主体功能区金融发展与经济增长关系的理论依据。利用金融深化论、金融供需论及金融因果论等金融发展理论,从不同角度对金融发展与经济增长的关系给予了理论解释,并借助金融——增长联动机制AK模型,从中找出促进经济增长的动力,理清主体功能区建设过程中金融的增长功能,为本文的实证分析和政策建议提供理论依据。接着本文在第三章中对新疆主体功能区金融发展与经济增长现状进行分析。研究发展新疆主体功能区经济增长表现出非均衡性,金融发展也存在较大差异,Theil指数的度量结果进一步说明了这种差异逐年扩大的现实。结合新疆实际情况,本章最后分析了新疆主体功能区金融和经济非均衡发展的原因。虽然新疆主体功能区金融发展与经济增长区域间都存在较大差异,那么主体功能区内区域金融发展是否适应经济增长的需要,金融发展与经济增长之间的关系如何,这将是第四章研究的主要内容,也是本文的研究重点。在第四章,本文运用协整分析、Granger因果关系检验、Var模型和方差分解等计量方法,对三地区金融发展和经济增长的关系进行了实证研究,结论表明：较快的经济增长与较快的金融发展相联系；短期内,新疆优化开发区和重点开发区属于“供给引导型”金融发展,限制开发区属于“需求拉动型”金融发展；长期内,新疆优化开发区和重点开发区金融发展促进了经济增长,并且优化开发区经济增长也导致了金融发展,而限制开发区金融发展与经济增长的长期关系统计意义上不显著,金融与经济严重滞后,金融只是被动地适应经济增长。为了充分发挥区域金融在新疆主体功能区经济发展中的作用,本文的建议是：既需要倾斜性金融政策,也需要与之协调搭配的财政政策；既要发展小额贷款公司和中小型银行机构,也要多设置专门的区域性政策金融机构。这样既可以有效提高新疆区域金融的发展水平,促进主体功能区经济增长,反过来经济的增长又可以刺激金融业的进一步深化。