辣椒是山东省主要种植蔬菜之一。近年来,随着辣椒种植面积的增加,辣椒病毒病的危害日益严重,多呈现复合性侵染,严重影响辣椒的生产,已成为制约山东省辣椒产量和品质的主要因素。本研究以分子生物学技术为基础,对山东省10个辣椒种植区域进行15种病毒病病原的检测与鉴定,基本摸清山东省各辣椒产区病毒病发生情况以及主次关系,以及病毒复合侵染情况,同时对辣椒脉黄化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)山东分离物进行全基因组序列的克隆与分析,并结合不同地区的PeVYV分离物,对PeVYV进行系统发育分析。主要结论如下:1.利用15种病毒特异性引物检测253份辣椒样品,检测到14种病毒病原,病原种类有:PMMo V、CMV、TMGMV、BBWV、BWYV、TMV、ToMV、TYLCV、PVY、MABYV、CABYV、PeVYV、AMV和ChiVMV,CaCV未检测到。国内首次报道的辣椒病毒病原为BWYV、MABYV、CABYV和PeVYV。2.253份样品病毒检出率达96.0%,在所检出的辣椒病毒病病原中,PMMo V与CMV的检出率最高,分别为61.6%、60.0%,是危害山东省辣椒的重要病毒病原;TMGMV、BBWV、BWYV和TMV的侵染辣椒的现象非常普遍,检出率为42.3%、34.3%、24.9%和24.5%;其中BWYV是国内首次报道侵染辣椒的新病毒,TMGMV也成为侵染山东辣椒的主要病毒病原。ToMV、TYLCV、PVY、MABYV、CABYV、PeVYV和AMV的侵染现象较少,检出率分别为10.6%、7.5%、6.7%、3.5%、2.3%、1.9%和0.3%。3.在243份阳性样品中,仅检测到34份样品为单一病毒的侵染,其余209份样品为2种及以上病毒的复合侵染,复合侵染率为86.0%。其中以3种病毒复合侵染辣椒样品所占比例最高,为30.4%,2种病毒及4种病毒的复合侵染辣椒样品次之,侵染率分别为27.9%,27.5%。4.通过重叠PCR的方法测定了PeVYV山东分离物全基因组,序列分析表明PeVYV山东分离物的核苷酸序列与GenBank上PeVYV全基因组核苷酸序列的一致率在90.0%以上。