SLA微卫星多态性及与免疫性状的关联分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vierilv
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本实验以长白猪、大白猪2个品种的100个个体为研究对象,采用微卫星技术,对SLA区域13个微卫星基因座的遗传多样性进行了研究,并运用最小二乘线性模型,对所研究的13个微卫星多态基因座与猪免疫参数进行了相关分析,结果如下: 1、13个微卫星位点在2个群体中的等位基因数在2~11之间,各基因座位多态信息含量为0.2592~0.7899,其中SLAMS052、SLAMS047、SLAMS050、S0013、SW1409、SWR74、SLAMS049、SLAMS048、SLAMS092、SLAMS095、TNF属于高度多态基因座,SLAMS094和SLAMS051属于中度多态基因座。13个微卫星基因座中,SLAMS052基因座有最大的总遗传杂合度(0.8109)变异较大,SLAMS051基因座总遗传杂合度(0.2844)最小。 2、2个群体在4个微卫星位点SLAMS094、SLAMS048、SLAMS092和SLAMS047均处于哈代温伯格平衡,在6个微卫星基因座SLAMS052、S0013、SW1409、SLAMS049、SLAMS095和TNF均不处于哈代温伯格平衡状态。在SWR74和SLAMS051基因座,长白猪处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05),大白猪则未达到哈代温伯格平衡状态(P<0.05);在SLAMS050基因座,长白猪未达到(P<0.05),而大白猪却达到哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。 3、4个微卫星基因座(SLAMS095、SLAMS094、SLAMS092、SLAMS051)进行单倍型分析发现,在二品种中共有53个单倍型,其中长白猪中有28个单倍型,大白猪中有42个单倍型,2品种共享17个单倍型。在长白猪中,主要单倍型由多到少顺序为:H3>H8>H4>H11>H2=H20,大白猪主要单倍型由多到少顺序为:H2>H7>H18>H12>H29=H30。 4、微卫星基因座与免疫参数关系最小二乘分析结果表明,SW1409基因座与?WBC(P<0.01)、#MON(P<0.05)显著相关;TNF基因座(P<0.05)与MCH、%GRA显著相关;SLAMS092基因座(P<0.05)与MCHC、%GRA显著相关;SLAMS095基因座(P<0.01)与%LYM极显著相关;S0013基因座(P<0.01)与#GRA极显著相关;SLAMS050、SLAMS052、SLAMS049、SLAMS051微卫星基因座(P<0.05)分别与MCH、MCV、#GRA、RBC显著相关。SLAMS095和SLAMS094基因组合型与免疫参数MCV相关;SLAMS092和SLAMS094与免疫参数#MON相关;SLAMS095和SLAMS051与免疫参数%LYM相关。
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