七株蝙蝠腺病毒基因组分析和感染性克隆的构建

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腺病毒能感染人和多种脊椎动物,并引起疾病。腺病毒也是一种常用的基因载体,在疫苗和基因治疗等领域有着广泛应用。腺病毒还是一种重要模式病毒,曾揭示过多种重要分子生物学机制。蝙蝠作为一种非常重要的病原宿主,携带种类繁多的病毒,包括一些与人类重要新发疾病密切相关的RNA病毒。虽然我们和其他实验室曾在一些蝙蝠中报道了高流行率和遗传多样性的腺病毒,但蝙蝠物种数量庞大,许多蝙蝠种类的腺病毒还有待发现和研究。  本研究主要内容包括:⑴从中华菊头蝠(Rhinolophus sinicus)分离到3株新的蝙蝠腺病毒(bat adenoviruses WIV9-11,BtAdV-WIV9-11)。其基因组分别为37545、37566和38073 bp,这些基因组彼此相似性很高,但与已知腺病毒基因组差异显著。值得注意的是,这三株病毒基因组E3转录单元中均包含一个极长的编码基因。根据系统发育分析和病毒学分类标准,这些蝙蝠腺病毒很可能代表哺乳动物腺病毒属(Mastadenovirus)的一个新种。细胞敏感性试验表明它们具有广谱细胞嗜性,暗示其潜在的广谱宿主范围。⑵从长翼蝠(Miniopterus schreibersii)分离到2株蝙蝠腺病毒(BtAdV-WIV12、13)。它们很可能代表Mastadenovirus属两个不同种。然而,它们的G+C含量仅34.2%和31.3%,明显低于同属其他成员;另外,其基因组也短于已知同属成员,分别为29581和29162 bp。统计分析表明,CpG双核苷酸受甲基化后突变为TpG(互补链为CpA)是造成低G+C的主要原因之一,因为腺病毒科内成员的CpG相对频率(即频率的比值比: odds-ratio)与TpG+CpA相对频率以及G+C含量存在显著相关性。有趣的是,腺病毒基因组G+C含量和CpG相对频率并不像其他一些病毒依赖宿主种类,而是呈现病毒种特异性。另外,其G+C含量和CpG相对频率分别与基因组长度呈现了中等和强的正相关性,表明了新的腺病毒进化模式。⑶从棕果蝠(Rousettus leschenaultii)分离到2株新的蝙蝠腺病毒(BtAdV-WIV17、18)。与WIV12、13类似,这两株腺病毒的基因组分别为29923和29812 bp,G+C含量分别为34.3%和34.2%。WIV17、18基因组彼此相似性较高,但与已知腺病毒差异明显。系统发育分析表明,它们可能代表Mastadenovirus属的一个新种。它们与其它感染食果蝙蝠(特别是棕果蝠)的腺病毒显示出较近的亲缘关系,表明其与宿主可能存在长期的共同进化关系。⑷建立了一种简单、经济的腺病毒载体重组技术。利用该技术,成功构建了BtAdV-TJM和WIV9的感染性克隆,以及用EGFP表达盒替换了E3A基因的TJM重组病毒。该重组病毒感染细胞后,可观察到强烈的绿色荧光,体现了TJM高效表达外源基因的能力。
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