2015年新修订的《环境保护法》第五十九条规定的环境违法“按日计罚”制度改变了以往“守法成本高,违法成本低”的环境处罚状况。但该制度在实际运行中还存在违背行政法公平正义原则、过罚相当原则等问题,其成因在于《按日连续处罚办法》中关于按日计罚前提条件之“拒不改正”的认定、该罚实施程序的规定和数额标准的设计均过于机械、原则,只考虑违法行为结果改正与否,却忽略了对行为过程改正情况的认定。本文以金海源公司与肇庆市环保局、市政府行政纠纷案作为典型案例进行了详细分析。本案的争议焦点主要有三点:即金海源公司是否存在“拒不改正”情形,环保局按日计罚实施程序及数额标准的设置是否合法合理。文章从案例争议焦点入手,依据《环境保护法》和《按日连续处罚办法》规定,通过对案例中“按日计罚”适用条件、实施程序及数额标准的计算方式等主要法律问题的分析,指出其在立法和执法方面存在的不足,进而分别从立法和执法角度提出完善建议。一是通过明确“拒不改正”情形的认定标准、细化“按日计罚”程序规定、完善“按日计罚”数额标准三个方面完善立法规定;二是通过建议生态环保部门切实规范自由裁量权之适用、实现环境执法理性公正和综合运用各类行政手段、全面履行环境监管职责两个方面完善执法适用。通过对立法和执法的完善,切实改善将按日计罚作为“万能型”处罚“一罚了之”的“一刀切”式执法现象,真正实现行政执法在防治环境污染的同时也能维护行政相对人的合法权益。以确保“按日计罚”制度能在符合行政法相关原则的基础上更好地发挥作用。