【摘 要】
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研究背景艾滋病（AIDS）是全球公共卫生健康最大的威胁之一.随着药物治疗的持续推进,逐渐出现了一些耐药问题.因此研究HIV/AIDS耐药株的传播趋势,可以为制定和评价防控措施提供重要的参考价值.研究方法针对中国异性间HIV/AIDS传播的四个主要亚型（CRF01AE,CRF07BC,CRF08BC和CRFBC）共计912条基因序列数据,我们应用贝叶斯系统发育分析分别推断它们各自的最近源祖先时间和有
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研究背景艾滋病（AIDS）是全球公共卫生健康最大的威胁之一.随着药物治疗的持续推进,逐渐出现了一些耐药问题.因此研究HIV/AIDS耐药株的传播趋势,可以为制定和评价防控措施提供重要的参考价值.研究方法针对中国异性间HIV/AIDS传播的四个主要亚型（CRF01AE,CRF07BC,CRF08BC和CRFBC）共计912条基因序列数据,我们应用贝叶斯系统发育分析分别推断它们各自的最近源祖先时间和有效再生数,以追溯HIV/AIDS在该人群中的传播动力学历史.同时,基于HIV/AIDS在异性间的传播特征,我们建立了动力学模型来预测HIV耐药株在未来的传播趋势.通过马尔可夫蒙特卡洛（MCMC）方法,我们将系统发育分析推断出的再生数与动力学模型推导出的再生数进行拟合,得到动力学模型中的不确定参数取值.考虑不同的HIV/AIDS防控措施对动力学模型进行数值模拟,预测和对比不同措施对耐药株传播的影响.研究结果通过对912条HIV-pol基因序列进行贝叶斯系统发育分析,我们推断出四个序列（CRF01AE,CRF07BC,CRF08BC和CRFBC）的最近源祖先时间分别是1994年（95%HPD:1991-1997）、1990年（95%HPD:1986-1993）、1993年（95%HPD:1991-1996）、1989年（95%HPD:1979-1997）.全国异性HIV/AIDS传播的有效再生数Reg从1994年的1.95到2018年下降至1.73,呈现先上升再下降最后趋于稳定的趋势.对动力学模型进行数值模拟和预测发现,仅仅提高治疗率对于降低感染的作用非常微小,而且会导致严重的耐药问题.而在理想治疗效果下则可以大幅度降低感染并且可以有效改善仅提高治疗率带来的耐药问题.此外,我们还研究了不同防控措施对于多重耐药动力学的影响,发现无论是基线还是防控措施下双重耐药和三重耐药情况都呈现上升态势,并且仅提高治疗率会加快上升速度.如果考虑理想治疗效果,虽然HIV/AIDS整体流行态势仍会呈现上升趋势,但是会减缓多重耐药的上升速度并且有效降低单重耐药的发生.
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