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在植物的发病早期快速、准确鉴定出病原菌,以防止其传播和流行、减少经济损失具有重要的意义。发展快速、灵敏、高通量的分子检测技术对提升我国植物病害控制水平,尤其是阻止外来农林危险生物入侵、保护我国农林经济安全生产与生态安全有着重要意义。目前基于PCR技术的分子检测方法无法满足对大批量样本检测的需要,因此寻找其他的分子检测靶标,发展植物病原菌高通量检测方法,对完善病原细菌分子检测技术、提升我国植物检疫的技术水平和提升我国植物病害控制水平具有重要意义。高通量是目前植物病原菌分子检测的发展方向,而基于PCR扩增的普通分子检测方法无法一次检测多种病原菌。因此,发展高通量检测方法对于农业生产和口岸检疫具有重要意义。分子探针和DNA阵列技术等技术的出现为发展植物病原菌高通量检测提供了新的思路和方法。Padlock探针是一种长的寡核苷酸探针,其两端的序列可通过与靶标DNA序列互补配对而使探针结合成环状。Padlock探针不仅具有非常高的特异性,同时还可与DNA阵列技术结合进行高通量检测。本研究设计了6种重要植物病原菌(Erwinia amylovora,Erwinia pyrifoliae, Pantoea stewartii subsp. stewartii, Acidovorax avenae subsp.citrulli, Xanthomonas oryzae py.oryzae, Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)的padlock探针,并对这些探针的特异性和灵敏度进行了验证。试验结果表明,所设计探针只能从对应的病原菌DNA中扩增出100bp大小的片段,而在非目的病原菌的DNA中不能扩增出片段。不同探针的灵敏度分别为10pg和1pg。将这些探针与Macroarray相结合,通过一次扩增能够同时检测6种病原菌,建立了这些植物病原菌的高通量分子检测技术,并将该技术应用于实际样品的检测。本文建立的高通量分子检测技术可望应用于口岸和田间对这些植物病原菌的检测。