PD-1基因多态性与慢性HBV感染家系的遗传易感性研究

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背景慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染一直是我国重要的公共卫生问题之一,严重危害人民健康。探讨慢性HBV感染易感性的机理,始终是乙型肝炎研究者们关注和研究的热点。HBV感染后,机体对病毒的清除能力以及疾病的进展和不同临床转归,除了与免疫因素、病毒因素和环境因素有关外,在很大程度上取决于个体间基因组的差异。从宿主遗传易感性的角度,来探讨慢性HBV感染易感性的机理,为将其作为生物标志物来预测HBV感染的发生、发展和结局提供了可能性。而以生物学功能相关基因作为侯选基因进行关联研究,是当前感染性疾病遗传易感性研究的主要策略。分子免疫学研究提示细胞程序性死亡受体-1(PD-1)及其配体(PD-L)通路能削弱、限制和/或终止T细胞和APC等细胞的活化及效应功能,在慢性HBV感染的发病机制中发挥了重要作用。本实验旨在探讨PD-1基因单核苷酸多态性(SNP)与中国汉族人群慢性HBV感染家系的遗传易感性。方法采用聚合酶链反应和限制性酶切片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测人类2号染色体长臂3区7带(2q37.3) PD-1基因多态性,并应用家系内关联性分析(FBAT)方法,首次分析256个中国汉族慢性HBV感染核心家系的PD-1基因的2个SNPs及单倍型与慢性HBV感染家系的遗传易感性。结果(1)通过对256个核心家系的流行病学调查,收集了包括539例慢性HBV感染者和353例未感染的家庭成员的一般流行病学资料和DNA血样,并对所有人员进行基因型的检测,筛查这些SNP在中国人群的频率。在539名患者中分别分析PD-1.1 G>A和PD-1.2 G>A两位点的基因型频率,PD-1.1 G>A,AA,AG和GG基因型的频率分别是16.6%,63.7%和19.7%,A和G等位基因的频率分别是48.4%和51.6%。PD-1.2 G>A,AA,AG和GG基因型的频率分别是22.8%,59.8%和17.4%,A和G等位基因的频率分别是52.7%和47.3%。两位点的基因频率分布经过χ~2检验均符合Hardy-Weinberg平衡定律(PD-1.1,χ~2 = 3.032,P = 0.082;PD-1.2,χ~2 = 0.25,P = 0.616);(2)对单位点采用家系内关联性分析软件FBAT分析显示,PD-1基因1.1和1.2位点单位点多态性与慢性HBV感染的遗传易感无显著的相关性(P > 0.05)。等位基因A和G与慢性HBV感染的遗传易感也无显著的相关性,其中在附加遗传模型[(PD-1.1,Z = -0.265,P = 0.790993;Z = 0.265,P = 0.790993依次);(PD-1.2,Z = 0.640,P = 0.522127;Z = -0.640,P = 0.522127依次),显性遗传模型[(PD-1.1,Z = -0.617,P = 0.537018;Z = -0.193,P = 0.846892依次);(PD-1.2,Z = -0.080,P = 0.936343;Z = -1.001,P = 0.316939依次)]和隐性遗传模型[(PD-1.1,Z = 0.193,P = 0.846892;Z = 0.617,P = 0.537018依次);(PD-1.2,Z = 1.001,P = 0.316939;Z = 0.080,P = 0.936343依次)]中的P值均大于0.05,显示无优势等位基因A或G从杂合的父母传递给患病子女。(3)传统的传递不平衡检验(TDT)和同胞对传递不平衡检验(SDT)分析显示无优势等位基因A或G从杂合的父母传递给患病子女(P = 0.688880,P = 1.000000依次)。(4)256个核心家系的单倍型分析通过单倍型的构建,显示在中国汉族人群中存在以下四种单倍型结构: PD-1.1A/PD-1.2A (46.3%) ,PD-1.1G/PD-1.2G(45.4%),PD-1.1G/ PD-1.2A (4.7%)和PD-1.1A/PD-1.2G (3.5%),但是FBAT单倍型分析结果显示无优势单倍型传递给患病子女或者患病同胞,在附加遗传模型,显性遗传模型和隐性遗传模型中的P值均大于0.05,显示传递的单倍型与慢性HBV感染的遗传易感无显著的相关性。结论PD-1基因1.1和1.2位点基因多态性与慢性HBV感染家系的遗传易感无相关性,该基因可能不能作为遗传标志来预测慢性HBV感染的发生。
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