根际促生菌Serratia marcescens LJL-11缓解紫花苜蓿盐碱胁迫作用的分子机制研究

来源 :哈尔滨师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:madfox1108
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
盐碱胁迫限制着作物生长和产量,植物根际促生菌(PGPR)通过多种方式促进植物生长发育并抵御盐碱胁迫对植物的影响。Serratia marcescens LJL-11能够在盐碱胁迫下促进紫花苜蓿的生长。本研究利用Illumina Hiseq?4000测序平台对接种或未接种S.marcescens LJL-11的紫花苜蓿(盐碱胁迫下)根组织进行了转录组测序,鉴定在此条件下起重要促生和抗逆作用的关键基因和代谢途径,旨在揭示S.marcescens LJL-11诱导紫花苜蓿盐碱耐受性的分子机制。主要研究结果如下:1.对紫花苜蓿进行转录组测序,共12个样品:3个时间点(0小时、6小时和24小时)、对照与接菌处理。每个样品质量Q30达90%以上,GC含量约41%,测序共获得320.93M reads,经过质检后拼接获得77,788条Unigenes,序列均长为949nt,N50值为1325 nt,与拟南芥和其他豆科物种的同源比对,共55,701(71.6%)条Unigenes获得注释。2.对Unigenes进行GO注释,共注释到42,607个GO条目,对Unigenes的结构进行分析,预测出43,952条CDS序列并鉴定出11,527个SSR位点。3.计算基因表达量并筛选出接种S.marcescens LJL-11后的差异表达基因(DEG),0H:2,585个、6H:2,037个和24H:2,238个。对DEGs进行GO功能分析,胁迫应答、防御反应和信号转导等相关的代谢活动获得富集较多;对DEGs进行MapMan注释分析从中发现重要的基因:HSP、ACO1、GH3等;对DEGs进行KEGG通路富集分析,涉及通路包括植物激素信号转导、氮代谢和MAPK信号传递途径等。此外,从DEGs中挖掘功能基因,其主要涉及胁迫响应、离子平衡、植物激素以及营养代谢相关代谢过程中,如:CHS、GH3、SAUR、ACO和MYC2等,而这些重要的功能基因与S.marcescens LJL-11诱导紫花苜蓿盐碱耐受性的分子机制密切相关。4.通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)实验验证了12个DEGs的基因表达模式,并将其与转录组结果进行相关性分析,结果表明DEGs的qRT-PCR结果和转录组结果的表达模式相一致。5.分析紫花苜蓿GH3基因家族,鉴定出14个Ms GH3成员,根据拟南芥的分组信息将MsGH3分到4个Group中,其中GroupⅠ(MsGH3.1~MsGH3.3)、GroupⅡ(MsGH3.4~MsGH3.6)和GroupⅣ(Ms GH3.7~MsGH3.14);利用CDD数据库对MsGH3的保守结构域进行分析发现都含有GH3结构域;预测MsGH3基因的编码蛋白序列并分析其基本理化性质;分析MsGH3在转录组中的表达模式,其在接种S.marcescens LJL-11后的3个时间点都上调表达;计算MsGH3基因的非同义替换和同义替换(Ka/Ks)比值(小于0.3),表明MsGH3基因在久远的进化中受到了强力的纯化选择,MsGH3基因功能保守。
其他文献
本文在充分考虑局中人的策略集是模糊子集的基础上,给出更一般化的具有模糊支付与模糊赢得的两人零和模糊对策的模糊规划模型。利用模糊数的序方法,得到了此对策求解问题可以转
本文主要针对货代可抵扣收入的会计核算与税务处理进行探讨,以帮助会计人员解决实际工作中所面,临的可抵扣暂时性差异。
现有的资产风险度量方法不能合理的反映收益的向上波动给投资者带来的风险感受,针对这一不足,本文提出了一种新的风险度量方法,这一方法综合考虑了投资者对于损失的规避和对
针对具有多种信息形式的多属性决策(MADM)问题,提出了一种决策分析方法。在本文中,首先描述了属性值为随机变量、清晰数和区间数三种信息形式的MADM问题;然后将这三种信息形式转化
高校辅导员在职业生涯中产生的职业倦怠,危害其身心健康,影响其工作成效,对辅导员个体、个体所在的部门或团队以及个体所在的组织会产生明显的负面影响.本文在深入分析职业倦
对于一个成功的企业而言,拥有一支稳定的、高素质的、上进心强的职工队伍,是必不可少的关键性因素之一,而要想打造一支优良的职工队伍,就必须加强后进职工转化工作。首先必须
本文对在构建和谐校园中充分发挥党员先锋模范作用的重要性和必要性进行了阐述,分析了影响高校教师党员充分发挥党员先锋模范作用的主要因素,并提出了相应的办法和建议。
随着素质教育的全面开展,信息技术的迅速发展和普及,信息技术与课程整合成为当今教育界讨论的热门话题。信息技术以其强大的技术功能带来了教育和学习方式的巨大变革,使它成为课
为贯彻“十二五”教育精神,结合《体育课程标准》,大课间体育活动以及课外体育活动有力更新的标准,健康、创新、和谐。以此为研究目的结合实际情况,在传统的活动基础上,创新活动形
本文在考虑需求率服从斜坡型分布的情况下,研究了允许缺货且缺货完全回补、变质率服从威布尔分布、补货率为无穷、有限计划期内的库存模型,证明了最优补货策略的存在性,并给