高新区是我国实施创新驱动发展战略的重要载体,高新区内的企业是引领全国创新的排头兵。统计数据显示,全国近四成的高新技术企业集聚在国家高新区内,高新区内企业的研发投入强度远高于全国平均水平。与区外企业相比,高新区内企业的创新竞争更激烈,企业在创新过程中受政策、集群环境的影响更严重。但目前理论界对企业创新决策过程的研究仍存在不足,尤其是各类创新政策对企业创新决策影响的“黑匣子”还有待揭开,实践中创新政策的制定及执行仍存在诸多困惑。因此,对国家高新区内的企业创新决策行为展开研究有重要的理论和实践意义。本研究在分析高新区演进的阶段性特征及不同阶段中企业的典型创新行为基础上,基于演化博弈、动态博弈、静态博弈和数值模拟仿真等方法,构建不同情境下考虑政策等多种因素综合作用下的企业创新决策博弈模型。采用Matlab软件,自主编写仿真程序进行数值模拟,以图形形式直观展示企业创新决策过程。本文的主要研究结论有:（1）我国高新区的发展经历了要素集聚、主导产业形成和创新生态系统形成3个阶段,每个阶段企业会面临新的创新决策问题。要素集聚阶段新企业为获取更多创新资源积极构建自身创新网络,主导产业形成阶段企业面临与集群内企业的研发竞争与合作问题,创新生态系统形成阶段异质创新主体间的创新合作行为增多,企业需要进行创新合作策略选择。（2）政府支持力度、网络嵌入带来的成本、收益、在位企业初始参与意愿等均对新创企业的网络嵌入过程及结果产生影响。结网初期集群在位企业的积极参与比政府支持更有助于新创企业成功嵌入网络;结网后期,政府可以逐渐退出对企业结网行为的支持。（3）企业研发决策受政策环境、集群环境、技术溢出、研发合作模式等多种因素的综合影响,不同情境下,以利润最大化为目标的企业应选择不同的研发模式。以社会福利最大化为目标的政府应对不同集群实施差异化的研发补贴策略,具体为:第一,供应链上下游企业应采用研发联合体模式,此时企业的研发投入、利润能够达到最大。政府应优先采用创新投入补贴策略,鼓励上下游企业间组建研发联合体,提高技术溢出。第二,对于生产同质化产品的竞争企业,如企业之间实力相当,应优先选择组建研发联合体,其次是研发协调和技术共享联盟,研发竞争是最劣选择。如企业之间实力相差悬殊,领导企业偏好研发协调和低技术溢出,追随企业偏好研发竞争和高技术溢出。政府在对龙头带动型集群企业进行补贴时,应优先选择创新投入补贴,而对多方势均型集群企业进行补贴时,各种补贴方式均能提高企业研发投入和社会福利。（4）产学研合作过程中,企业、科技特派员和学研机构三方合作策略的选择受合作成本、收益、政府支持力度的影响,同时各方的合作行为选择彼此相互影响。此外,建立合理的利益分配机制是促进产学研合作形成、保障科技特派员政策有效运行的关键。与政府奖励科技特派员相比,政府补贴企业更能有效促进各方积极参与产学研合作。基于对现有研究不足的分析,本文构建了一系列企业创新决策模型,力图从研究方法和研究内容上实现突破和创新,创新之处主要有:（1）研究方法上的创新。区别于企业创新研究中常用的多元统计、传统博弈等定量分析方法,本文系统地引入源于生物学的演化博弈论和源于计算机学科的离散系统模拟与仿真等前沿性研究方法。一方面,采用过程导向为主的演化博弈论以动态刻画新创科技型企业集群网络嵌入过程中相关博弈主体的互动行为以及科技特派员制度下的产学研合作形成机制。另一方面,为交叉验证理论推导结果且直观展示各博弈方的策略选择过程,采用Matlab软件,自主编写仿真程序进行数值模拟。（2）研究内容上的创新。（1）从动态演化视角研究新创科技型企业集群网络嵌入过程,拓展了企业网络嵌入相关研究。区别于从静态视角检验网络嵌入结果对企业创新活动和创新绩效影响的现有研究,本文对新创企业网络嵌入过程中集群在位企业的行动响应以及政府支持对网络嵌入速度和嵌入结果的影响,有助于揭开企业网络嵌入过程的“黑匣子”。（2）探究多因素综合作用下的企业研发投入决策行为,丰富了企业研发决策相关研究。区别于研发决策影响因素相对单一的现有研究,本文分别针对高新区不同集群类型构建企业研发决策模型。综合考虑研发补贴策略、技术溢出、研发模式、研发难度、企业制造效率等因素对企业研发决策的影响,理论模型更贴近实际,更具一般性。（3）从动态演化视角分析科技特派员制度下的产学研合作形成机制,进一步拓展了产学研合作行为研究的深度和广度。企业科技特派员制度相关研究文献寥寥无几。本文分别构建府补贴企业和政府奖励科技特派员两种情境下的产学研合作创新三方演化博弈模型,研究影响企业、科技特派员和学研机构合作行为选择的关键因素,对比分析了政府补贴对象差异对各参与方合作积极性的影响。