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目的: 探讨儿童系统性红斑狼疮(pediatric systemic lupus erythematosus，pSLE)患者基因组DNA甲基化水平在发病过程中的变化、LINE-1序列甲基化水平的变化及其与病情活动度、补体C3及血浆同型半胱氨酸的相关性。 方法: 一、对象为2010-2012年在我院风湿免疫科确诊的pSLE患儿。选取pSLE患儿外周血单个核细胞的DNA标本为病例组，同期采集健康查体儿童DNA标本为对照组。S LEDAI≥10分为疾病活动组，＜10分为相对静止组;按年龄分为＜12岁和≥12岁组。取100 ng DNA标本，加入0.25 UBenzonase核酸酶，0.3 mU磷酸二酯酶Ⅰ和0.2 U碱磷酸酶，用Tris缓冲液控制pH值在7.9，37℃水解6小时。利用Agilent1200-6410B液相色谱-串联质谱仪和Agilent ZORBAX SB-AQ C18(2.1×50 mm，3.5μ)色谱柱对水解后样品分离定量。优化方法在5 min内完成一份样品检测，并行方法的日内稳定和日间稳定性评价，证明方法稳定可靠。实际样品进样量为10μL，检测模式为MRM模式。测定5mdC和dG的峰面积比。以dG为内标，用标准曲线计算标本中DNA总体甲基化水平。 二、通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF)联合RNA碱基特异性剪切法(MassCLEAVE)测定外周血单个核细胞中LINE-1甲基化水平，以及应用化学发光法测定血浆总同型半胱氨酸(tHcy)水平。 结果: 一、病例组38例，男女比8∶30，年龄4-18岁，对照组30例，男女比11∶19，年龄8～18岁。病例组＜12岁16例，≥12岁22例;对照组＜12岁28例，≥12岁2例。SLEDAI≥10分12例，SLEDAI＜10分26例。病例组基因组DNA甲基化水平（5.89％±0.41％）低于对照组（6.75％±0.79％），差异有统计学意义(t=-5.613，P＜0.001)。病例组按＜12岁组与≥12岁组组间比较，其基因组DNA甲基化水平差异无统计学意义，对照组依同样方法分组比较，组间甲基化水平无明显差异。分别比较两组中男女间甲基化水平，差异无统计学意义(P＞0.05)。SLEDAI＜10分和SLEDAI≥10分组分别与对照组比较，甲基化水平均存在差异(p＜0.001);SLEDAI＜10分和≥10分组之间差异无统计学意义(p=0.993)。 二、病例组59例，男女比16∶43，年龄4-18岁，对照组47例，男女比16∶31;年龄6-18岁。pSLE病例组及健康对照组的LINE-1甲基化水平分别为60.93％及62.88％，二者比较差异显著(p=0.001)。病例组LINE-1甲基化水平与SLEDAI评分相关（r=-0.285，P=0.032）。病例组LINE-1甲基化水平与C3显著相关(r=0.317，P=0.044)。低甲基化水平者pSLE发病风险升高(AOR:14.5;95％ CI:2.8，75.6)。病例组血浆同型半胱氨酸水平显著高于对照组，(分别为15.11μmol/L及11.02μmol/L，P=0.028)，LINE-1甲基化与血浆同型半胱氨酸显著相关(r=-0.4，P=0.013)。 结论: pSLE患者基因组DNA甲基化水平降低，LINE-1序列甲基化水平降低，LINE-1甲基化水平与pSLE病情活动度及补体C3显著相关，与血浆同型半胱氨酸水平显著相关。