福氏5b痢疾杆菌的基因组以及比较基因组研究

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本文对福氏5b痢疾杆菌的基因组以及比较基因组进行了研究。主要内容包括: 1) Sf8401的全基因组是一条环形染色体。染色体基因组全长4,574,284 bp,共包含4,714个ORFs,整个基因组G+C含量为50.92%,核糖体RNA组成为7/7/8,与K-12及Sf301相同。 2)通过与Sf301的比较,发现两者大约有97%的基因组序列是共享的,这些共享的序列说明它们之间非常保守的进化关系。 3)通过比较基因组学的研究,发现在Sf8401和Sf301染色体上的主要毒力岛当中存在着较大的差异。在毒力岛SHI-O中,发现Sf8401和Sf301的组成成分明显不同。 4) 在已知毒力基因方面, Sf8401的毒力基因明显少于Sf301,同时两者的IPAH基因在结构和位置上也存在着差异。结合上面说到的毒力岛的差异,这些可能是Sf301和Sf8401之间在毒力和致病性以及流行特征上产生差异的主要原冈。 5)在代谢途径上与Sf301相比,发现在Sf8401中特异的保存着甜菜碱合成途径所必需的基因簇。 6) 通过对Sf8401基因组与其它志贺菌及大肠杆菌聚类分析以及选取7个基因进行进化分析,发现在进化与分类上Sf8401与Sf301、2457T的关系最近,同时还可以发现志贺菌同大肠杆菌的进化关系非常接近。
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