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高产是玉米育种的主要目标。选育耐密植玉米品种,依靠群体产量来增加单产是实现玉米再高产的必然趋势和方向。自交系作为育种的基础材料,研究自交系的耐密性问题已成为育种的热点。本研究以238份玉米自交系为试验材料,设置2个不同的密度水平,75000株/hm2和135000株/hm2。研究不同密度下,各自交系农艺性状的表现,筛选出耐密性评价指标并建立玉米自交系耐密性评价体系,结合关联分析找到相应的SNP标记。本试验的主要研究结果如下:1.通过对两密度下各指标的变异系数分析,筛选出用于评价玉米自交系耐密性的三个指标:单株产量、秃尖、ASI。2.建立了玉米自交系耐密性评价指标单株产量、秃尖、ASI的分类评价体系。利用评价体系对自交系群体进行分类评价。利用建立的评价体系从本试验材料中筛选了十个耐密性材料,包括B283-1、良玉S122、丹黄212、L201、D25-2-1-1-1、pr07007-1、pr07438-2-2-1、黄早四、SN7135、Y32-1-1-1-1-1。该评价提系对新材料的耐密性鉴定及育种有一定使用价值。3.玉米自交系耐密性评价指标相关性状的SNP关联分析。本研究找到的SNP中,-Log(P)值较高(MLM模型)且基因分型较好的被认为是较重要的SNP。与单株产量降幅相关的较重要的(-log p>3.0)SNP有15个,位于2、3、4、5、6、7和8号染色体上;与秃尖差值相关的较重要的(-log p>4.5)SNP有26个,位于1、4、7和10号染色体上;与ASI差值相关的较重要的(-log p>4.5)SNP有13个,位于1、4和8号染色体上。运用MLM模型,与单株产量降幅相关的较重要的(-log p>3.0)SNP有8个,位于1、3、4、5和9号染色体上;与秃尖差值相关的较重要的(-log p>4.5)SNP有13个,位于1、4、7和10号染色体上;与ASI差值相关的较重要的(-log p>4.5)SNP有12个,位于1、4和8号染色体上。两种模型共有的与单株产量降幅相关联的SNP标记有4个,与秃尖差值相关联的SNP标记有13个,与ASI差值相关联的SNP标记有12个。