近年来,基于系统生物学的网络药理学随着生命科学的研究趋势而兴起,成为药物发现的一种新的范式。将网络药理学引入中医药的研究成为中药现代化发展的契机。应用网络药理学方法的中药作用机理研究,涉及中药方剂、化学成分、生物组织和疾病的基因/蛋白质、以及生物通路等一系列数据,它们种类多、数量大,构成复杂的网络。节点种类以及联系众多的复杂性造成了网络的难以理解和掌握。现今结合计算机图形计算等技术的可视化图形拥有直观、易于理解、交互性强等特点,使得复杂网络可视化技术成为应用网络药理学方法研究中药作用机理的可靠工具。由于现今互联网的普及以及结合网络药理学方法的中药作用机理研究的热潮,基于Web的中药作用机理网络的可视化可以对中医药的研究起到重要的辅助作用,应用Web技术可以实现远程访问从而获取可视化信息。本文主要使用JavaScript可视化程序库Cytoscape.js等Web技术实现中药作用机理网络的网页交互可视化。通过对中药方剂数据、中药数据、中药化学成分数据、化学成分靶蛋白数据、疾病表现型基因数据以及生物通路数据的理解和整理得到中药作用机理的相关数据共67GB,并构建了中药作用机理数据库。使用基于Fisher精确检验的过表达分析方法分别对中药方剂靶蛋白、疾病表现型基因以及人体组织基因/蛋白质的进行生物通路的富集分析。基于浏览器/服务器三层软件架构实现了远程访问服务器获取用户输入中药方剂、疾病以及人体组织相关的网络数据,包含中药、中药化学成分、中药化学成分靶蛋白、人体组织和疾病相关基因/蛋白质以及生物通路等,完成在浏览器端的中药作用机理网络的Web可视化。