沉默COL1A1的小干扰RNA表达质粒建立及抑制COL1A1表达的有效序列的筛选

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:cheqiu
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目的:肝纤维化是慢性肝病共有的病理改变,其本质是以胶原为主的ECM合成增多,而降解相对减少,两者失去动态平衡,致使过多ECM沉积于肝内,ECM中主要成分是胶原,而胶原中以Ⅰ型胶原蛋白为主,现已证明HSC激活是产生Ⅰ型胶原导致纤维化发生发展的中心环节。RNA干扰(RNAi)是一种能达到特异性抑制目的基因表达的现象,己成功地下调了一些内源性基因的表达。我们目的是通过构建表达COL1A1小干扰RNA(siRNAs)的质粒,筛选出对肝星状细胞中Ⅰ胶原有影响序列。 方法: 从NCBI网站获得大鼠的COL1A1cDNA序列,根据Whitehead研究所的siRNA设计软件设计3条理论上最佳的siRNA序列,相应的双链DNA被插入pGPU6/GFP/Neo质粒中,即pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C。为了得到高效沉默COL1A1-siRNA,以脂质体LipofectAMINE2000将各组siRNA1μg、2μg、3μg、4μg转染含荧光蛋白(GFP)质粒于HSC-T6细胞中,观察转染效果。然后,将最佳沉默siRNA剂量导入HSC-T6细胞,转染后24h传代,加入G418进行筛选,2周后挑取单克隆株扩大培养。获得稳定表达细胞系,分别建立表达pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C和阴性对照的单克隆大鼠肝星状细胞株。应用RT-PCR分析pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-N组的COL1A1mRNA的表达水平。 结果: 靶向COL1A1mRNA的3个shRNA重组质粒载体pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C经测序分析,shRNA编码序列与设计的片段完全一致,经酶切凝胶电泳证实载体构建成功.观察1μg、2μg3μg、4μg组转染效果分别为16.7%、20.3%、23.5%、22.3%,以2ug siRNA为最佳剂量,RT-PCR分析pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C,对COL1A1mRNA的抑制率分别为16.6%、63.3%、80.3%。 结论: 筛选出的pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C表达质粒能高效地抑制转染细胞COL1A1mRNA的表达,从而为肝纤维化治疗提供新的方法和材料。
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