基于T-RFLP技术的肉鸡消化道微生物群落多样性的研究

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本课题主要利用末端限制性片段长度多态性( Terminal-restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)技术研究了肉仔鸡盲肠微生物群落的多样性及其动态变化,并就日粮中添加金霉素与纤维素对肉仔鸡消化道微生物群落发育的影响进行了研究。试验一肉鸡消化道微生物群落多样性研究方法的建立根据肉鸡消化道微生物的16S rDNA特性,运用通用引物,通过对模板添加量、引物添加量、反应体系、退火温度等PCR条件的优化,对酶切反应时间的探索以及对peak scanner软件、T-RFLP数据分析、网络数据库运用的探究,建立了运用T-RFLP技术研究肉鸡消化道微生物群落的方法。试验二肉鸡盲肠微生物群落多样性及其动态变化的研究本试验利用T-RFLP方法,主要探讨肉鸡盲肠微生物群落多样性及其动态变化,以期更好的认识肉鸡盲肠微生物,为探索肉鸡肠道微生态营养的机理提供理论依据。试验表明:肉鸡不同周龄时,其盲肠微生物群落多样性的各指数均有所变化,但无显著差异(P>0.05)。随着周龄的增加,盲肠微生物群落的菌种丰富度有所下降,优势菌种越来越明显。试验获得有代表性的相对含量大于0.5%的优势片段中,T-RF36、T-RF37、T-RF39、T-RF57、T-RF164、T-RF168、T-RF188所代表的菌群属于正常菌群(原籍菌群);T-RF52、T-RF186、T-RF244所代表的菌群属于暂住菌群。T-RFLP方法能够较好的分析肉鸡消化道微生物群落多样性及其动态变化。试验三金霉素对肉鸡回肠微生物群落多样性的影响试验利用T-RFLP方法,主要探讨了金霉素对肉鸡生长前期回肠微生物群落多样性的影响,以期为金霉素的应用提供理论基础,并探索了金霉素的微生物检测方法。结果表明:在肉鸡生长发育前期,金霉素影响着其回肠末端微生物群落的多样性,试验获得了多个细菌菌群的T-RF片段,其中有代表性的相对含量大于0.5%的片段共17个,金霉素对优势菌群T-RF28、T-RF216、T-RF596具有抑制作用,对T-RF48、T-RF87、T-RF88、T-RF95、T-RF168、T-RF255菌群具有促进作用。利用T-RFLP方法可以检测到金霉素对肉鸡回肠中使用传统方法无法培养的菌群的影响,并能检测到对金霉素较敏感的菌群,即T-RF596、T-RF95所代表的菌群,可以将这两个片段作为金霉素微生物检测的目的片段。试验四纤维素对肉鸡回肠微生物群落多样性的影响试验利用T-RFLP方法,探讨了纤维素对肉鸡回肠微生物群落多样性的影响,以期能更好的揭示日粮中的纤维素水平对消化道微生物群落的影响规律。结果表明:纤维素影响着肉鸡回肠末端微生物群落的多样性,随纤维素水平的升高,微生物种类有所减少,优势菌种越来越明显。试验获得了多个细菌菌群的T-RF片段,其中有代表性的相对含量大于0.5%的片段共15个,纤维素促进了片段T-RF29、T-RF31、T-RF43、T-RF180、T-RF220、T-RF481所代表微生物的增殖,抑制了片段T-RF38、T-RF596所代表微生物的增殖。T-RFLP方法能够很好的揭示纤维素对回肠微生物群落多样性的影响,并为纤维素营养的深入研究与应用提供了理论参考。
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