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目的:筛选大肠癌相关lncRNAs和mRNA,并进行生物信息学分析,以期探讨lncRNAs在大肠癌发生发展过程中的作用。方法:选取4对大肠癌组织及癌旁组织,提取总RNA,芯片分析癌组织和癌旁正常组织中差异表达的lncRNA和mRNA,并对差异表达的mRNA进行GO聚类分析及KEGG信号通路分析,同时构建LncRNA-Wnt信号通路相关mRNA的共表达网络,对大肠癌中LncRNA与Wnt信号通路的功能相关性进行预测。结果:芯片数据显示,与癌旁组织相比,大肠癌组织中1989个LncRNA表达上调,1534个LncRNA表达下调;1471个mRNA表达上调,1044个mRNA表达下调。聚类分析显示,上调基因富集程度最高的分别是DNA metabolic process、non-membrane-bound organelles、protein binding;下调基因主要集中于organic hydroxyl compound metabolic processes、extracellular regions、steroid binding。差异表达基因KEGG信号通路分析显示,上调基因集合主要涉及22条信号通路,其中富集度最高的信号通路是Systemic lupus erythematosus;下调基因主要涉及24条信号通路,其中富集度最高的是Drug metabolism-cytochrome P450信号通路。结论:(1)大肠癌组织LncRNA表达与癌旁组织存在明显差异;(2)大肠癌组织中LncRNAs与Wnt信号通路相关基因存在共表达,提示我们LncRNA可能参与了大肠癌的发生、发展过程。