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在爪蟾和斑马鱼中,Kaiso是一种在整个基因组范围内与甲基化CpG序列特异性结合的转录抑制因子,在调控被甲基化基因表达的时间模式中起重要的作用。为深入研究DNA甲基化对我国重要养殖鱼类生殖和发育的影响,我们克隆了鲫鱼Kaiso基因的cDNA序列,并对其时空表达模式进行了分析。该cDNA全长3145bp,5-非翻译区132 bp,3-非翻译区1117 bp,开放阅读框1896bp,编码631个氨基酸。鲫鱼Kaiso蛋白与其他物种Kaiso蛋白的同源性分析表明,与其他物种一样,其N端和C端分别有高保守性的BTB/POZ结构域和锌指结构域。整胚原位杂交结果显示,Kaiso mRNA在早期胚胎发育的各个时期均广泛表达,信号均一,但从尾芽期开始出现组织特异性表达差异。对不同发育阶段胚胎的实时定量PCR检测结果表明:卵子中有高丰度的母源Kaiso mRNA存在;在卵裂期至囊胚中期胚胎中Kaiso mRNA的丰度逐渐降低;从囊胚中期至原肠早期都维持在最低水平状态;原肠后期其表达水平又逐渐升高,至尾芽期达到与未受精卵中相当的高水平后在器官发生期的整体水平又稍有下降。Kaiso mRNA丰度的在胚胎发育早期的这种变化过程提示在卵裂期检测到的mRNA可能都是母源mRNA,合子核Kaiso基因可能是在囊胚晚期后才开始转录。对成体不同组织的实时定量PCR检测结果表明Kaiso的表达存在明显的组织特异性差异,在鲫鱼肌肉、视网膜、心脏和脑中表达水平较高,而在肾、胰、肝等器官中表达水平很低。Kaiso表达的时间和组织特异性提示其作为甲基化基因的转录抑制因子参与了胚胎和成体基因表达时空模式的调控。这些结果为进一步研究Kaiso和DNA甲基化修饰在鲫鱼发育调控和遗传育种中的作用提供了基础资料。