论文部分内容阅读
屏边空竹(Cephalostachyum pingbianense(Hsueh et Y.M.Yang ex Yi et a1.)D.Z.Li et H.Q.Yang)是目前世界上唯一在自然条件下能够四季产笋的竹种,是优良的笋材两用竹。但当前对屏边空竹种质资源的研究严重滞后,该竹种仍处于待开发的自然生长状态。了解其发笋习性和幼竹生长规律是开发利用该竹种资源的基础。本论文的研究内容主要包含以下三个方面:(1)揭示屏边空竹的发笋、笋-幼竹生长规律;(2)探究植物内源激素对屏边空竹笋芽萌发及幼笋高生长的调控;(3)对屏边空竹转录组概况进行分析,从转录组水平上初步探究屏边空竹笋芽萌发的分子调控机制。主要研究结果如下:
1.屏边空竹发笋、笋-幼竹生长规律:(1)笋期历时9个月左右(9月至次年5月),根据出笋量的差异可分为初期、盛期和末期,春季出笋最多而夏季最少;共5丛(16.67%)有四季发笋的习性。(2)退笋率随笋期逐渐增加,在末期达到最高(87.76%)。(3)笋-幼竹高生长约130d完成,平均秆高达6.36m;呈现“慢-快-慢”的生长规律,生长曲线可用三次曲线方程描述:H=0.806-0.029t+0.001t2-5.894×10-6t3,R2=0.980。(4)地径的生长历时16d左右,平均地径为18.50mm,也呈现“慢-快-慢”的生长规律。
2.植物内源激素对屏边空竹笋芽萌发及幼笋高生长的调控:(1)一年中各组织中四种激素水平相似,均为IAA>ABA>ZR>GA3;(2)较高的ZR含量可能促进笋芽的萌发,而较高的IAA含量及IAA/ABA、IAA/ZR比值则可能不利于笋芽的萌发;(3)幼笋中较高的ZR含量及GA3/ABA、ZR/ABA、IAA/ABA比值可能有助于其高生长;(4)笋芽的IAA含量从出笋率较低的季节到出笋率较高的季节呈增加的趋势,ABA、ZR和GA3则相反,这可能与笋芽营养物质的积累以及生长发育有关。
3.利用转录组探索屏边空竹笋芽萌发的分子调控机制:(1)转录组概况分析:屏边空竹进行转录组分析共获得34.1Gb clean reads,组装得89,345条Unigenes:GO分析主要注释到细胞过程(cellular process)、细胞组成(cell part)、结合(binding)等32个二级GO条目;KEGG代谢通路分析主要富集到代谢途径(Metabolic pathways)、次生代谢产物的生物合成(Biosynthesis of secondary metabolites)等21条KEGG代谢通路。(2)调控屏边空竹笋芽萌发的分子机制:①对笋芽萌发过程中的差异基因进行GO富集分析,在cellular process、cell part、binding等31个二级GO条目中富集的基因数较多;进行KEGG代谢通路富集分析,共富集到134条代谢途径,其中核糖体(Ribosome)、植物激素信号转导(Plant hormone signal transduction)、苯丙烷生物合成(Phenylpropanoid biosynthesis)等16条代谢途径存在显著差异;②在Plant hormone signal transduction中筛选出的表达差异显著的7个基因:IAA23、IAA33、SAUR32、SAUR71、PYL8、PYL4、PP2C68,推测它们可能参与调控屏边空竹笋芽的萌发。③在Phenylpropanoid biosynthesis中共筛选出4个差异基因,分别为CCR4、CCR3、4CL1、PAL3,推测它们可能在其幼笋的木质素积累过程中发挥重要作用。④淀粉和蔗糖代谢(Starch and sucrose metabolism)也包含多个差异基因,可能同样在笋芽萌发中起重要作用。
1.屏边空竹发笋、笋-幼竹生长规律:(1)笋期历时9个月左右(9月至次年5月),根据出笋量的差异可分为初期、盛期和末期,春季出笋最多而夏季最少;共5丛(16.67%)有四季发笋的习性。(2)退笋率随笋期逐渐增加,在末期达到最高(87.76%)。(3)笋-幼竹高生长约130d完成,平均秆高达6.36m;呈现“慢-快-慢”的生长规律,生长曲线可用三次曲线方程描述:H=0.806-0.029t+0.001t2-5.894×10-6t3,R2=0.980。(4)地径的生长历时16d左右,平均地径为18.50mm,也呈现“慢-快-慢”的生长规律。
2.植物内源激素对屏边空竹笋芽萌发及幼笋高生长的调控:(1)一年中各组织中四种激素水平相似,均为IAA>ABA>ZR>GA3;(2)较高的ZR含量可能促进笋芽的萌发,而较高的IAA含量及IAA/ABA、IAA/ZR比值则可能不利于笋芽的萌发;(3)幼笋中较高的ZR含量及GA3/ABA、ZR/ABA、IAA/ABA比值可能有助于其高生长;(4)笋芽的IAA含量从出笋率较低的季节到出笋率较高的季节呈增加的趋势,ABA、ZR和GA3则相反,这可能与笋芽营养物质的积累以及生长发育有关。
3.利用转录组探索屏边空竹笋芽萌发的分子调控机制:(1)转录组概况分析:屏边空竹进行转录组分析共获得34.1Gb clean reads,组装得89,345条Unigenes:GO分析主要注释到细胞过程(cellular process)、细胞组成(cell part)、结合(binding)等32个二级GO条目;KEGG代谢通路分析主要富集到代谢途径(Metabolic pathways)、次生代谢产物的生物合成(Biosynthesis of secondary metabolites)等21条KEGG代谢通路。(2)调控屏边空竹笋芽萌发的分子机制:①对笋芽萌发过程中的差异基因进行GO富集分析,在cellular process、cell part、binding等31个二级GO条目中富集的基因数较多;进行KEGG代谢通路富集分析,共富集到134条代谢途径,其中核糖体(Ribosome)、植物激素信号转导(Plant hormone signal transduction)、苯丙烷生物合成(Phenylpropanoid biosynthesis)等16条代谢途径存在显著差异;②在Plant hormone signal transduction中筛选出的表达差异显著的7个基因:IAA23、IAA33、SAUR32、SAUR71、PYL8、PYL4、PP2C68,推测它们可能参与调控屏边空竹笋芽的萌发。③在Phenylpropanoid biosynthesis中共筛选出4个差异基因,分别为CCR4、CCR3、4CL1、PAL3,推测它们可能在其幼笋的木质素积累过程中发挥重要作用。④淀粉和蔗糖代谢(Starch and sucrose metabolism)也包含多个差异基因,可能同样在笋芽萌发中起重要作用。