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PPARα基因属于核激素受体超家族的成员之一,在脂类代谢中起着重要作用。本研究采用PCR-SSCP、CRS-PCR-RFLP、DNA测序等方法检测了固始鸡-安卡鸡F2代资源群849只个体PPARα不同基因片段的多态性,对单核苷酸多态性进行了群体遗传学分析,同时进行了基因多态位点与经济性状的关联分析,结果如下:1、经过PCR-SSCP检测发现Pl扩增片段上有一个A→T错义突变（g.A23884T）,通过BglⅡ酶切出现AA和AB两种基因型;P3扩增片段上发现一个G→A错义突变（g.G29201A）,通过BsiEI酶切出现CC和CD两种基因型;P4扩增片段上发现一个T→C同义突变（g.T32311C）,通过BspHI酶切出现EE、EF、FF三种基因型。2、将鸡PPARα基因不同位点多态性与屠体性状进行相关分析,结果表明,P1位点不同基因型对肝脏重和肝脏率的影响差异显著（P<0.05）;P3位点不同基因型对胰腺率的影响差异显著（P<0.05）;P4位点FF基因型的肌胃重大于EF基因型,差异极显著（P<0.01）;EF和FF基因型的肝脏率与EE基因型相比,差异均显著（P<0.05）。3、将鸡PPARα基因不同位点多态性与脂肪、肉质性状进行相关分析,结果表明,P1位点不同基因型对腹脂重、腹脂率以及胸肌失水率的影响差异显著（P<0.05）;P4位点不同基因型对腹脂重、腹脂率的影响差异极显著（P<0.01）,EE型和EF型的腹脂重、腹脂率大于FF型,差异均显著（P<0.05）。4、将鸡PPARα基因不同位点多态性与生长性状进行相关分析,结果表明,P3位点不同基因型对出生重和2周龄体重的影响差异极显著（P<0.01）,CC基因型的8、12周龄胫长、8周龄骨盆宽大于CD基因型,差异显著（P<0.05）;CD基因型的4周龄胸角大于CC基因型,差异显著（P<0.05）;P4位点不同基因型对6周龄体重、4周龄体斜长的影响差异极显著（P<0.01）,对4周龄体重、4周龄胫围、4、8、12周龄胸骨长、4周龄骨盆宽影响差异显著（P<0.05）。5、将鸡PPARα基因不同位点多态性与血液生理生化指标进行相关分析,结果表明,P1位点不同基因型对总蛋白、肌酐的影响差异显著（P<0.05）;P4位点EE、EF基因型的高密度脂蛋白与FF型相比差异显著（P<0.05）。6、将鸡PPARα基因三个多态位点的组合基因型与经济性状进行关联分析,结果表明,不同组合对屠体性状中肌胃重、肝脏率、胰腺率的影响差异显著;对生长性状中出生重、6周龄体重的影响差异极显著（P<0.01）,对4周龄体重、8、12周龄胫围、12周龄胸骨长的影响差异显著（P<0.05）;对脂肪和肉质性状中腹脂重、腹脂重率以及胸肌失水率的影响差异显著,基因型组合ABCCEE的白蛋白含量与AACDEF相比,差异极显著（P<0.01）。