随着国际贸易的不断增长、国铁集团“交通强国、铁路先行”的发展以及我国物流产业转型升级的持续推进,港口物流系统逐渐成为港口企业竞争力的主要因素,而港口地区联运运输组织模式是港口物流系统的重要组成部分。由于铁路运输具有更好的安全性、经济性和环保性,港口联运运输组织系统中铁路部门发挥着重要作用,加快发展海铁联运,优化海铁联运运输组织模式,对于路港双方今后的发展具有重大意义。本文从国内外海铁联运的现状及发展出发,简要分析海铁联运港站运输组织系统的现状和发展趋势。结合海铁联运港站运输组织目前的实际情况和路港双方合作中存在的问题,明确优化海铁联运港站运输组织的重要性和必然性。通过运量预测和能力计算的方式研究海铁联运港站中路港双方运输组织能力,并针对港站运输组织的结构特点和存在问题,从增强“前店”、“后场”配合协调度,实行路港一体化办公,实行路港直进直出模式,建立路港数据信息共享平台四个方面提出优化港站运输组织模式的主要对策。最后,以丹东港港口为实际案例,提出丹东港港站运输组织模式优化建议,并结合实际进一步研究港站运输组织模式优化过程中仍需解决的问题,并得出最后结论。