虽然近几年我国农产品电商取得了飞跃地发展,农产品电商平台亏本运营却是行业现状,因此急需对农产品电商平台的运营策略进行研究,为之提供一套科学的理论指导。由于农产品容易损耗,对物流水平要求很高,高昂的物流成本是农产品电商平台亏损的重要原因之一,因此在研究农产品电商平台的运营策略时应该重点考虑农产品的物流成本。本文以农产品电商平台为研究对象,基于双边市场理论,将农产品的物流成本考虑到B2C市场的双边市场定价模型中,做出关于注册费的定价、物流费用的分配、物流体系的投入等多个变量的决策。研究表明:无论是垄断平台还是竞争平台,物流成本由平台来承担时,在平台注册的消费者与商家的市场份额都是最大的。同时在竞争市场,平台的物流水平越高,越有利于增强平台的交叉网络外部性效应,接入平台的消费者和商家的规模也就越大,并且物流成本由消费者来承担时,平台的利润最大,平台的注册费与平台的物流水平正相关。考虑到平台提供的基础服务（包括信息服务、质量检查、安全支付、广告推介、市场交易等方面）与农产品的种类和品质有相互促进的关系,因此本文假设s为平台的基础服务与农产品之间的互补参数,并将它考虑到B2C市场的双边市场定价模型中,提高模型的适应范围。研究表明:无论物流成本由平台来承担还是由商家来承担,当0<s<2^1/2,物流水平越低平台向商家收取的注册费用反而越高;当s>2^1/2时,平台向商家收取的注册费与平台的物流水平成正比,即平台的物流水平越高,平台收取的注册费越高;同时,当0<s<3^1/2时,农产品的需求量与平台的物流水平成正比,平台的物流水平越高,农产品的需求量越高;s>3^1/2时,农产品的需求量与平台的物流水平成反比,平台的物流水平越高,农产品的需求量反而越小。