桃品种遗传多样性分析及核心种质的构建

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:oskarguan
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以国家种质资源圃(北京)编目的558份桃品种的18个形态和农艺学性状为基本数据,研究了桃品种初级核心种质构建的取样策略,以获得最佳的初级核心种质;优化桃SSR反应体系,利用SSR分子标记对桃种质资源的遗传多样性进行分析,结合形态学标记确定了桃核心种质的最佳取样方案;构建出桃的核心种质,并对核心种质的有效性进行检测,研究结果如下:1.桃品种初级核心种质取样策略的研究表明,适宜总体取样比例为10%,以按品种类群分组结合遗传多样性比例取样为构建桃初级核心种质的最佳取样方案。利用此取样策略从558份桃品种中提取56份作为初级核心种质,对其代表性进行检测表明所构建的初级核心种质能够很好地代表桃原始种质的遗传多样性。 2.以‘新大久保’桃为试材,利用正交设计直观分析法和两因素完全随机试验优化了桃SSR技术中PCR反应体系,.并利用30个品种进行验证。在25μLPCR反应体系中,各种反应物终浓度或用量的最适范围分别为:Mg2+1.5~2.0mmol/L;dNTP0.20~0.28mmol/L;引物0.2~0.6μmol/L;模板DNA50~100ng;Taq聚合酶lU。该体系具有较好的重复性和稳定性。 3.以桃的初级核心种质为研究材料,利用SSR分子标记技术对桃初级核心种质的遗传多样性进行分析,共筛选出22对多态性高、特异性好的SSR引物;检测到116个等位基因,平均每个位点的等位基因数为5.3;各品种类群的遗传多样性大小顺序为:蜜桃>硬肉桃>蟠桃>油桃>水蜜桃>黄肉桃;中国品种的遗传多样性指数要高于引进品种的遗传多样性指数;聚类分析表明:56份供试材料在相似系数为0.786处分为5类,各品种类群没有明显的分开,存在交叉现象。 4.通过对桃初级核心种质的形态农艺性状(MOR)数据和SSR等位基因数据的分析,研究了四种取样方法下各取样比例的多样性指数、保留比例及各频率段的等位基因的丢失比例,确定了桃核心种质的取样方案,并利用数量性状对所构建的核心种质的代表性进行分析。结果表明,聚类取样的方法优于随机取样,在80%的取样比例下SSR+MOR聚类取样效果最好;利用此方法构建的核心种质共包含45份材料,其保留了初级核心种质96.6%的SSR等位基因和原始种质99.49%的形态农艺性状,代表性检测表明所构建的核心种质能够较好的代表558份桃原始种质的遗传变异。
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