1912年5月北洋政府交通部正式开始运作，在当政者的支持下，它以交通系为骨干，利用其知识、金融、官僚资本，对铁路事业进行了全面革新。 在行政方面，交通部主要进行了集中、统一两方面的工作。交通部先后撤销铁路总局、中国铁路总公司，将铁路事业的管理权归于路政司；统一了各路局的编制、部局的各种规章等。在路务方面，交通部利用己成铁路规划全国路网、实现铁路勘测的多元化促使铁路建设的快速发展；制订了一套铁路技术标准规范其建设；以购物条例的颁布等降低铁路成本。在营运方面，交通部克服重重困难开展联运工作，使中国铁路开始形成一张网；利用运价的涨落实现铁路经济效益的增长或承担一定的公益责任；组建铁路警备力量，提高铁路的安全系数；整顿车站秩序，为客货主提供一个较好的环境；加强宣传，扩大铁路的运输影响；推行货运负责制，稳定铁路货源。在政策方面，交通部在干路国有、资金挹注、民营与国营等方面都有处理欠妥之处，不良的政策还激化了政府与民众、中央与地方的矛盾，加剧了交通部执政的危机。 总之，交通部大规模移植西方的管理制度，开创了中国铁路的新局面，但由于缺乏适合的环境加之自身的软弱性，也为中国的铁路发展埋下了较大的隐患。