综合电子系统是皮卫星的数据和指令枢纽,承担皮卫星数据处理、数据存储、数据传输及指令收发、响应等重要任务,是皮卫星的核心组成部分。皮卫星综合电子系统大都采用高性能商用处理器,其性能一般都能满足系统需求,可靠性是皮卫星综合电子系统研究的重点。三模冗余是提高系统可靠性的一种常用方法,通常有基于时钟同步和基于任务同步两种途径实现。相对于任务同步,基于时钟同步的三模冗余系统降低了软件设计复杂度,具有更好通用性,无疑是皮卫星综合电子系统的首选。本文对基于时钟同步的三模冗余系统进行研究,根据三模冗余系统研究要求,结合皮卫星实际工程应用需求,完成了高可靠综合电子系统的方案设计及硬件实现,经测试表明设计的综合电子系统满足皮卫星工程应用需求。对三模冗余系统时钟同步问题进行了研究,结果表明DSP程序运行在片内时,3个DSP可以实现时钟同步,DSP程序运行在片外时,3个DSP不能保证时钟同步；对时钟不同步原因进行了分析,通过分析和实验发现DSP CPU与EMFIB口间通信有可能是DSP程序运行在片外时不同步的原因。