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本研究以新生羔羊为动物模型,在羔羊出生后1日龄内补喂瘤胃液(试验一)或益生菌(分别补喂植物乳杆菌、枯草芽孢杆菌、植物乳杆菌和枯草芽孢杆菌混合菌,试验二),每天一次,连续14天,28日龄时屠宰收集胃肠道组织及内容物,应用高通量测序技术、分子技术及常规免疫技术对28日龄羔羊胃肠道菌群以及肠道黏膜免疫相关指标的测定,探讨瘤胃液或益生菌对羔羊胃肠道菌群的影响,以及对羔羊机体免疫的调节。试验一结果显示:1、与对照组相比,瘤胃液组羔羊28日龄瘤胃内容物中厚壁菌门和放线菌门丰度值显著降低(P<0.05),拟杆菌属相对丰度值极显著升高(P<0.01),乳杆菌属相对丰度值显著升高(P<0.05);显著增加了回肠内容物双歧杆菌属相对丰度值(P<0.05),使羔羊空肠和回肠黏膜中乳杆菌属增加,降低了拟杆菌属、大肠杆菌属丰度值,但差异均不显著(P>0.05);极显著增加了结肠内容物中乳杆菌属比例(P<0.01)。2、补喂瘤胃液提高了羔羊十二指肠中TLR2(P<0.05)、TLR4(P<0.05)和CD14 mRNA(P<0.01),降低了NF-κB mRNA相对表达量(P>0.05);使羔羊空肠中所有基因的相对表达量均低于对照组;提高回肠中TLR2(P<0.01)、TLR4(P<0.05)、CD14(P>0.05)和NF-κB mRNA(P<0.01)相对表达量。3、补喂瘤胃液提高空肠和回肠段中SIgA含量(P<0.05),回肠IgG含量(P<0.05)。4、补喂瘤胃液提高羔羊十二指肠中IL-6含量(P<0.01),空肠中TNF-α含量(P<0.05),降低空肠中IL-1b含量(P<0.01),回肠IL-1b和IFN-γ的含量(P<0.01)。5、补喂瘤胃液对羔羊血浆中免疫球蛋白、细胞因子、羔羊小肠内容物中的IgG和Fc含量以及肠道绒毛长和隐窝深无显著影响(P>0.05)。试验二结果显示:1、在瘤胃内容物中,与对照组相比,混合菌组厚壁菌门相对丰度值显著降低(P<0.05),枯草芽孢杆菌组和混合菌组中放线菌门相对丰度值均显著降低(P<0.05);补喂枯草芽孢杆菌降低十二指肠内容物中拟杆菌门(P<0.01),增加了乳杆菌属(P<0.05),降低了大肠杆菌属(P<0.05);空肠内容物中,补喂植物乳杆菌增加双歧杆菌属(P<0.01),枯草芽孢杆菌增加梭菌属丰度值(P<0.05),空肠黏膜中,试验组降低了大肠杆菌(P<0.05)、拟杆菌属丰度值(P<0.01),枯草芽孢杆菌和混合菌增加梭状杆菌属丰度值(P<0.05);回肠内容物中,补喂枯草芽孢杆菌提高了粪球菌属(P<0.01),降低了大肠杆菌属(P<0.01),混合菌提高拟杆菌门(P<0.01)、疣微菌门(P<0.01)、普氏菌属(P<0.01)、乳杆菌属(P<0.05)和瘤胃杆菌属(P<0.05),降低了Turicibacter(P<0.05),回肠黏膜中,补喂枯草芽孢杆菌提高放线菌门(P<0.05)和绿弯菌门(P<0.05),混合菌提高了拟杆菌门(P<0.05);结肠中,植物乳杆菌提高梭菌属(P<0.01),枯草芽孢杆菌提高普氏菌属(P<0.01)。2、补喂益生菌使羔羊十二指肠TLR2mRNA相对表达量分别是对照组的1.27倍(P>0.05)、0.44倍(P<0.01)和1.27倍(P>0.05),TLR4 mRNA相对表达量分别是对照组的3.41倍(P<0.01)、0.76倍(P>0.05)和1.34倍(P>0.05),CD14 mRNA相对表达量分别是对照组的4.84倍(P<0.01)、0.83倍(P>0.05)和2.03倍(P<0.05),NF-κB mRNA相对表达量分别是对照组的0.54倍(P<0.05)、0.38倍(P<0.01)和0.40倍(P<0.01);使羔羊空肠段TLR2 mRNA相对表达量分别是对照组的1.89倍(P>0.05)、2.87倍(P<0.05)和1.38倍(P>0.05),TLR4 mRNA相对表达量分别是对照组的1.48倍(P>0.05)、1.56倍(P>0.05)和4.3倍(P<0.01),CD14 mRNA相对表达量分别是对照组的1.35倍(P>0.05)、2.09倍(P<0.05)和3.95倍(P<0.01),NF-κB mRNA相对表达量分别是对照组的3.88倍(P<0.01)、2.23倍(P>0.05)和4.49倍(P<0.01);在回肠段TLR2 mRNA相对表达量分别是对照组的1.04倍(P>0.05)、2.72倍(P<0.01)和2.34倍(P<0.05),TLR4 mRNA相对表达量分别是对照组的2.20倍(P>0.05)、1.98倍(P>0.05)和2.38倍(P>0.05),CD14 mRNA相对表达量分别是对照组的0.79倍(P>0.05)、1.98倍(P<0.05)和2.01倍(P<0.05),NF-κB mRNA相对表达量分别是对照组的1.23倍(P>0.05)、1.59倍(P<0.05)和1.56倍(P<0.05)。3、补喂枯草芽孢杆菌和混合菌使羔羊十二指肠中SIgA含量显著降低(P<0.05);空肠中,补喂植物乳杆菌SIgA含量极显著高于混合菌组和对照组(P<0.01),补喂混合菌降低IgA含量(P<0.05),升高IgG含量(P<0.05);回肠中,试验组与对照组IgA、SIgA和IgG未有显著变化(P>0.05)。4、补喂植物乳杆菌提高十二指肠段IL-6含量(P<0.01),降低TNF-α含量(P<0.05),补喂枯草芽孢杆菌和混合菌提高空肠IL-6和TNF-α含量(P<0.01),提高回肠TNF-α含量(P<0.01)。5、补喂益生菌对羔羊血浆中免疫球蛋白含量影响不大,对7、14日龄血浆中细胞因子影响较大。6、补喂益生菌对羔羊小肠内容物中IgG和Fc含量无显著影响(P>0.05);补喂枯草芽孢杆菌增加羔羊空肠段隐窝深(P<0.05),补喂植物乳杆菌增加羔羊回肠中iIELs(P<0.01),十二指肠和空肠中MC细胞(P<0.05)。结果表明,28日龄羔羊胃肠道中含有种类丰富和数量巨大的细菌菌群,厚壁菌门和拟杆菌门为主要的优势菌群。给新生羔羊补喂瘤胃液或益生菌均有利于羔羊胃肠道菌群的建立,能增强羔羊肠道黏膜免疫,但不引起机体过度免疫。