HMT家族新成员SET07生化特性及功能研究

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 解放军军事医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jeffery2010
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目的:调控细胞生长基因功能紊乱是肿瘤发生、发展的一个重要原因。而基因表达调控是认识细胞如何分化和细胞如何癌变的关键机制。近来研究表明组蛋白的修饰参与调节基因转录的活化及抑制,改变染色体状态,进而影响细胞的生长周期、肿瘤的发生发展。尽管目前发现组蛋白存在乙酰化、磷酸化位点,但对其甲基化及其作用机制却知之甚少。本研究以生物信息学为基础,从人体胎儿组织中克隆得到组蛋白甲基化转移酶(HMT)家族新成员SET07基因,并研究其结构及理化特征、生物学功能,与个体发育、肿瘤发生发展之间的关系,为深入探讨组蛋白甲基化.染色质-肿瘤之间的关系奠定基础。方法:首先采用“电子”cDNA文库筛选法,获得一新基因,并对其生化性质进行了理论预测。在此基础上,通过RT-PCR方法从胎儿脾脏中扩增得到该基因cDNA序列,并对其进行一系列的理化性质研究,包括Northern Blot鉴定其转录子的大小、构建了含有GST标签的SET07原核表达载体、高质量融合蛋白表达为制备抗体和功能实验奠定了良好的基础,制备抗SET07多克隆抗体、Western Blot等实验对其蛋白水平的表达进行了观察。最后,针对SET07是否具有组蛋白甲基转移酶的功能及作用底物,进行了HMT实验;并通过SET07 cDNA在不同组织、不同种属、不同发育阶段和肿瘤细胞中的表达谱初步观察SET07与个体发育、肿瘤发生发展的关系。结果:以SET结构域为基础,电子拼接获得了由6条EST序列组成的3160bp的新基因序列。经生物信息学预测该基因定位于2号染色体上,与HS2. 34670有96%的一致性,分布无组织特异性;蛋白由351个氨基酸组成,大小39KDa,等军事医学科学院硕士毕业论文电点9.57,氨基端6一26位存在跨膜螺旋结构,缺乏疏水区和信号肤;由于该未知蛋白与H4一KZO甲基转移酶、SETS高度同源,故推测可能具有甲基转移酶的功育旨。 该基因序列从胎儿脾组织中扩增获得证实,其ORF为1044bP,位于+12一+1055,命名为SET07。SET07 mRNA的大小为3388bp。在成功优化GST-sET07蛋白片段的原核表达条件及制备了效价高于1:1(XX)的抗SET07多克隆抗体之后,W七stem Bfot发现SE功7蛋白存在于胞核及胞浆,其中胞核中仅以49KDa的一种形式存在,而在胞浆中SET07却以大小不等,介于39一49KDa之间的四种形式存在。 HMT实验表明SET07蛋白片段可将同位素标记的甲基转移至组蛋白H4、HZA/HZB及H3上,具有组蛋白甲基转移酶的功能。表达谱研究发现SET07基本存在于所有来自于肿瘤及胚胎的细胞系、胎儿组织以及增生较为旺盛的子宫内膜组织中,但在来自正常肾小管上皮细胞的HK-2细胞系、正常的胆囊组织中SETD7则分别发生5,端及3’端片段部分缺失。不同发育阶段的739胚鼠、739新生鼠、739成鼠的表达结果显示在胚胎期SEm7广泛表达于各组织,至新生鼠及成鼠期,SE功7的表达趋于局限,仅见于新生739鼠的皮肤组织及739成鼠的辜丸组织中,其余组织未见表达。 结论:1.本研究从人体中发现并克隆了含有sET结构域的新基因,将其命名为SET07,获得Gll5029566的GenBank序列号。2.本研究发现SETD7作为组蛋白甲基转移酶以49KDa的复合体形式在胞核内发挥作用,从而证实了SETD7为HMT家族一新成员。3.本研究初步发现SETD7与细胞增生、个体发育、肿瘤发生发展之间具有的密切关系,为进一步探索组蛋白甲基转移酶对基因转录调节的机制、肿瘤发生发展机理奠定了基础。
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