大理地区单纯感染和Mtb/HIV双重感染Mtb的MLVA法基因分型研究

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目的探讨MLVA基因分型法在云南大理地区单纯感染者和合并HIV双重感染者结核分枝杆菌基因分型中的运用,初步研究两种来源不同临床分离株的基因型特征。方法收集大理地区单纯感染肺结核患者和合并HIV双重感染肺结核患者的痰标本,经培养鉴定后运用MLVA法进行基因分型研究。本研究选取15个数目可变串联重复序列(VNTR)特异位点,运用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳技术初步建立检测大理地区结核分枝杆菌DNA指纹图谱方法。运用Quantity One和Bio Numerics(6.6)软件对实验获得的结果进行数字化处理并进行聚类分析。对结核分枝杆菌基因型成簇率、优势菌株分布和人口学等信息运用SPSS19.0统计软件进行统计分析。基因分型的家族结果通过与数据库比对来获得。结果1.通过MLVA法进行基因分型研究,15个位点中分辨能力最高的为MIRU26(HGI=0.839),分辨能力最低的为MIRU4(HGI=0,341)。2.通过运用UPGMA法将122株单纯感染临床分离株和1株H37Rv减毒株分为7个基因群;61株双重感染者临床分离株和1株H37Rv减毒株分为5个基因群。两组中H37Rv减毒株均不在优势基因群中。3.分别将122株临床分离株基因型和61株合并HIV双重感染者临床分离株基因型与数据库比对。结果显示单纯感染基因型中北京家族基因型所占比例为63%,双重感染者基因型中北京家族基因型所占比例为66%。4.全基因组和优势基因组之间在性别(χ2=0.029,P=0.508)和北京家族基因型所占比例(χ2=0.408,P=0.314)方面差异无统计学意义;单纯感染和双重感染在性别(χ2=2.169,P=0.099)间的差异无统计学意义;单纯感染者和双重感染者在年龄(χ2=9.055,P=0.002)间的差异有统计学意义。5.单纯感染者和双重感染者的流行基因型主要是北京家族基因型。结论1.大理地区合并HIV双重感染者和单纯感染者所感染的结核分枝杆菌基因型无差别,特别是合并HIV双重感染者所感染的结核分枝杆菌没有特殊性,均已北京家族基因型为主。2.大理地区122株肺结核患者结核分枝杆菌临床分离株有较高的基因多态性,其中主要的基因型是北京家族基因型。所以在该地区的结核病防治工作中要着重注意北京家族基因型结核分枝杆菌。3.122例肺结核患者是否感染北京家族基因型或者优势菌株基因型结核分枝杆菌与患者的年龄和性别无关。4.单纯感染者与双重感染者在性别上没有差别,但在年龄方面双重感染者中患者主要集中在18-45岁之间的青壮年。5.大理地区的肺结核患者是否感染成簇性基因型菌株、优势基因型菌株与患者的性别与年龄都无关系。
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