严峻的现实要求环保NGO代表公众参与到环境保护中来，我国最新修改的民事诉讼法也赋予了环保NGO这一权利，ENGO参与环境民事公益诉讼已然师出有名。无权利则无救济，本文研究的即是环保NGO在环境民事公益诉讼之中如何行使这一权利，研究其在诉讼程序和审理机制上有哪些制度层面和操作层面的保障。简言之，也就是研究作为一个特殊的环境民事公益诉讼主体，环保NGO在其中如何发挥作用的运行机制。环保NGO参与到环境民事公益诉讼运行中去，是在民事诉讼的模式下，在社会本位理论的支持下独立的行使以环保NGO为代表的公民、社会组织的环境权利，保障其环境利益，因而在动力机制，主体机制，程序机制，证明机制等方面具有鲜明的环境公益性特点。　　除结语外，本文分七个部分。　　第一章前言部分，介绍了运作机制和环境民事公益诉讼的相关理论背景，提出了严峻的环境状况要求环保NGO参与环境民事公益诉讼来，需要构建其运行机制的观点。　　第二章运作环境中，着重从应然和实然的角度进行了相关分析，阐释了良好运行应该具备的内在环境和外在保障，强调了环境民事公益诉讼运行的功能与价值，以及环保 NGO参与到其中的现实意义和理论基础，换言之，即阐明了环保NGO的原告资格的诉权来源及其理论基础；最后言及运行现状，系统的提出了其运行障碍和所需宏观保障。　　第三章动力机制则从动力源泉，动力缺陷等方面分析了环保NGO参与到环境民事公益诉讼运行中的主观阻碍，从根源上解释为何环境纠纷势如井喷，环保两庭却门可罗雀，并针对性的提出了动力激励和引导机制，对其诉权加以保障和规范。　　第四章涉及到诉讼发动和主体机制。无论环境民事公益诉讼如何运行，总离不了诉讼主体的参与，因此该章以环保NGO为角度，从管辖、受案范围、诉讼主体及第三人的法律地位、环保NGO的勤勉阻止义务等方面逐层剖析了环境民事公益诉讼的发动机制。　　第五章审判机制释明了获得原告资格后，环保NGO参与到环境民事公益诉讼运行的具体途径，并从环保NGO享有的诉讼权利、诉讼审理的专门化、审理过程中的非诉适用、审理终结的裁决和救济等角度构建了相应的审判程序。　　第六章是审判之中独立出来的证明机制，以对案件焦点的举证责任分配、证明负担减轻、证明标准盖然化为侧重，将因果关系推定、盖然性证明标准引入环境民事诉讼机制，与举证责任倒置相结合的构成了诉的证明。　　最后本文从效力机制和反馈机制着手，从利益分配、效力扩张、执行和社会支持等方面论述了环境民事公益诉讼的运行效力及其保障，以促进环保NGO参与环境民事公益诉讼运行机制的良性发展为目标。