公司章程是公司据以成立、运作和终止的重要法律文件,也是对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力的重要法律文件。公司章程的自治性及其必要性决定了章程在公司事务中的重要作用。但公司章程自治存在缺陷,必须接受法律规范的强制性指导。同时提高公司股东对公司章程重要性的充分认识,更好地发挥公司章程的自治性应有作用,保护自己的合法权益。本文共分四个部分。第一部分论述了公司章程的内涵、性质与公司章程与股东资格确认之间的关系三部分内容。首先通过对两大法系对公司章程内涵的不同理解以及通过分析学者们对公司章程性质的不同认识,明确了公司章程在公司的重要地位,总结出“自治”是公司章程的重要特点。其次论述了公司章程与股东资格确认之间的关系,公司章程股东资格确认的重要标志,但不是唯一的标志。第二部分在第一章的基础上,从公司章程自治是私法自治在公司法上的体现,公司章程自治是公司自治的主要载体,公司契约理论三个层面阐释了公司章程的自治的内涵。在论述公司章程自治与股东自治的关系的基础上,进一步说明公司章程自治的重要价值。第三部分是从公司章程自治的缺陷及其成因角度入手,否定了章程完全自治理论,阐述公司章程自治的缺陷导致大股东控制小股权利,小股东权利的丧失,进而会对社会市场经济造成的严重影响。第四部分是本文的最后一部分内容,阐述如何完善公司章程的自治性,界定公司章程自治的边界,分析说明章程自治与国家强制之间的辩证关系以及公司章程对小股东权利的特殊保留。提高小股东利用公司章程维护自己的合法权利的意识。