高校作为我国科技发展中最重要的科研主体，在科研创新中发挥了重要的作用，因此高校的科研绩效如何在一定程度上也影响了我国科研整体的发展。对高校科研绩效进行评价是对高校进行科研管理的重要手段，但是目前在我国还没有专门的全国性的高校科研绩效评价机构与评价体系，并且对高校科研绩效的研究也大部分是对科研活动效率或创新效率的研究，缺少对科研管理绩效的研究。在数据的选取上也多是截面数据，而缺少对科研管理绩效的时序研究。　　本文选取我国“211工程”中的25所综合性高校作为研究对象，运用随机前沿面分析(SFA)、聚类分析以及面板数据回归分析的方法对其在2006年到2009年的高校科研管理绩效进行了研究。本文不仅得出了这25所高校各时期针对每个产出指标的相对管理绩效，还对其进行了分类。另外，还利用面板数据回归分析的方法对高校科研投入结构对其科研管理绩效的影响进行了研究。　　本文的创新点有三:首先从研究内容上看，本文的研究对象为高校的科研管理绩效评价，是专门针对高校科研活动中管理的绩效进行的研究;其次，从研究方法上看，本文运用随机前沿面分析(SFA)的方法对高校的相对管理绩效进行研究，通过将误差分解为随机误差和管理无效率项，从而单独将管理的绩效表现出来，之后采用了聚类分析的方法将各高校进行分类，以去除由于对各指标主观赋权带来的影响，这为高校科研绩效的评价提供一种新的研究思路;最后，从数据的选取上看，本文选取了25所综合性大学2006年到2009年高校科研的面板数据，并运用面板数据回归分析对高校科研投入结构对其科研管理绩效的影响进行了分析。