在全球经济迅猛发展的今天,产业集群作为区域经济发展的重要形式,在我国很多地区发挥着越来越重要的作用。近年来,随着产业集群发展的逐步成熟,集群内的市场分工也在不断的细化,并且衍生出多层级的供应链。然而不可避免的是,企业在增加灵活性和提升市场适应性的同时也限制了其对关键技术的突破以及市场空间的开拓。这些因素导致在技术更新逐步加快、市场竞争日益激烈、环境更加复杂和不确定的知识经济时代,企业已难以靠自身力量及传统竞争方式立于不败之地。因此,通过企业间的合作创新来实现产业集群供应链的技术进步与不断发展显得越来越重要。本文以供应链管理、供应链协调以及区域经济发展理论为理论基础,以三方博弈模型为依据,对产业集群内供应链上企业间进行合作创新的必要性以及如何进行合作投资进行了研究。本文的主要研究内容是：(1)以供应链协调理论为基础对集群供应链的概念进行了界定,并认为产业集群供应链具有复杂多样性、本地一体化的完整性、发展阶段性以及中小型企业普遍适应性等特点;(2)以供应链管理理论为基础对产业集群供应链组织模式进行了划分。认为产业集群供应链可以分为单核式集群供应链组织模式、多核式集群供应链组织模式以及无核式集群供应链组织模式,其中多核式集群供应链又可以分为平行多核式、交叉多核式供应链组织模式；(3)从优势互补、资源共享、风险分担、创新能力、成果运用、信息流通等方面分析了集群供应链上企业间合作创新的必要性；(4)根据三方博弈模型构建了集群供应链内上游原材料供应商、中间产品制造商以及下游产品经销商之间的合作模型,得出了合作创新的投资额、投资分配比率以及合作投资后的各厂商以及集群供应链总体的利润,并以浙江温岭市摩托产业集群为例论证了模型的有效性,得出相关结论;(5)从政府、集群供应链以及企业三个层面提出了促进产业集群供应链上企业合作创新的政策建议：①政府应当从政策法规、区域文化等方面提高集群的合作意识以及合作能力,并且要加强科研成果向现实生产力的转化,同时要促进集群产业结构升级,为区域经济的长期发展奠定基础;②集群供应链层面上,首先要加强集群内产业链上各个要素的信息共享程度,其次要优化集群内部收益率低的要素,再次要完善集群内部的供应链网络；③企业层面上,首先企业要加强自身的合作创新意识,建立技术创新体系,其次要充分发挥供应链上核心企业的主导地位。如此才能保证产业集群供应链上企业间的协作创新有效的进行。本文认为,产业集群作为区域经济发展的重要组织形式,提高其内部供应链上企业间的合作创新能力对区域经济的发展具有重大的推动作用。通过上述研究可以得出集群供应链上企业间合作创新的投资额以及合作创新投资额的分配比率,对提高集群供应链的合作创新效率从而带动区域经济增长具有一定的理论意义和现实意义。