于杭州市郊采集一点红萝卜植株，提取叶片组织中的dsRNA，获得2条大小在1700-2000bp范围之内的dsRNA条带。此结果与我们以前报道的结果类似。采用SPAT和RT-PCR方法获得上述dsRNA条带的cDNA。克隆测序的结果显示两条较大的dsRNA条带长度分别为1866bp和1791bp，且核酸序列与我们以前报道的RasR1和RasR2完全相同。与此同时我们还得到一条新的序列，全长1778bp，将其命名为RasR6。 RasR6正链中含有一个ORF，编码的蛋白质含有502个氨基酸，分子量约为55.1kDa。在GenBank数据库中通过BLAST-P程序搜寻序列与之相似的蛋白并以此推测RasR6的功能。结果显示有5条蛋白序列与RasR6编码的蛋白具有同源性，且这5条序列均编码Partitiviridae成员的CP(coatprotein)。根据以上分析我们推测RasR6的功能是编码萝卜某一病毒的CP。 RasR6中A、G、T和C的含量分别为24.63％、18.11％、26.43％和30.82％，很明显G的含量比其它三种碱基的含量低，这种现象在已报道的Partitiviridae成员中普遍存在。RasR6与RasR.1的5’UTR长度分别为79bp和70bp，二者同源性为65.4％，共同拥有4个保守区域，包括末端的5’AGAAAAA笔TTT3’。RasR6的3’UTR(190bp)明显长于RasR1的3’UTR(74bp)，它们之间的同源性为25.7％，但两者也有一些保守区域，包括3’末端的5’AAAATAAAA3’。RasR6序列两端的UTR分别与相应RasR2序列两端的UTR有较高的同源性。RasR6与RasR2的5’UTR长度相当，分别为79bp和77bp，同源性高达82.3％，二者具有3个较长的保守区域，包括末端的5’AGAAAAATTTTAGA3’；RasR6与RasR2的3’UTR长度也相当，分别为190bp和196bp，二者同源性为66.0％，并且同时具有多个保守区域，包括3’末端的5’TAAAAAAAA3’。此外，RasR2和RasR6的全长序列也拥有多个保守区域，二者同源性为54％。但是，核苷酸序列比对结果同时也显示：RasR6与来源于萝卜的RasR3，RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。 根据RasR1，RasR2和RasR6共存于同一株萝卜的事实(克隆和杂交实验结果均证实这一结论)以及它们之间UTR比对的信息，我们推测这三条dsRNA同属于已经报道的Raphanussativusvirus1(RasV1)。由于RasR6与5个Partitiviridae成员的CP具有一定的相似性，据此推测RasR6与RasR2共同编码该病毒的CP，但同时也不排除它作为satelliteRNA存在的可能性。 关于RasR6也编码RasV1的CP与目前对Partitiviridae成员的描述不一致，如果RasR6编码CP，那么RasR6与RasR2二者之间是如何相互作用的?为什么Raphanussativuscrypticvirus1中含有两种不同的CP?以上问题都有待于深入研究。因此，本研究的结果为正确定义该科病毒特征奠定了基础。