【摘 要】
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目的:神经性疼痛(Neuropathic pain)是一种因躯体感觉神经系统的原发性损伤/功能障碍而导致的慢性和潜在致残性疼痛,因其治疗方案有限和预后不良而臭名昭著。以往研究表明MicroRNA(miRNA)与神经性疼痛的发生有关。但是,尚未建立全面的miRNA-mRNA调控网络。方法:从GEO数据库获得miRNA和mRNA微阵列数据集。然后,我们采用R软件工具对miRNA和mRNA微阵列数据集进
【基金项目】
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项目名称:阿片类药物对肝癌细胞生物学的影响,项目合同编号:2014GXNSFAA118224,项目来源:广西自然科学基金,项目起止时间:2014年1月至2020年5月
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目的:神经性疼痛(Neuropathic pain)是一种因躯体感觉神经系统的原发性损伤/功能障碍而导致的慢性和潜在致残性疼痛,因其治疗方案有限和预后不良而臭名昭著。以往研究表明MicroRNA(miRNA)与神经性疼痛的发生有关。但是,尚未建立全面的miRNA-mRNA调控网络。方法:从GEO数据库获得miRNA和mRNA微阵列数据集。然后,我们采用R软件工具对miRNA和mRNA微阵列数据集进行差异表达分析。mi RWalk 3.0数据库预测了差异表达miRNA的潜在的靶基因。mRNA数据集用于鉴定差异表达基因。数据库预测的靶基因于mRNA芯片中鉴定的差异表达基因的交集为可能靶基因。接下来,对差异表达基因进行GO注释和KEGG途径富集分析。随后我们建立了miRNA-mRNA调控网络,并通过Cytoscape软件可视化。进一步筛选mi R-133b-3p用于具体的分子机制研究。结果:从GEO数据库下载的转录谱经过预处理,数据归一化后,共鉴定出15557个RNA,包括1178个miRNA和14379个mRNA。与假手术样本相比,在SNI样本中总共鉴定出79个差异表达的RNA(27个miRNA和52个mRNA),以进行进一步分析。差异miRNA包括16个下调的miRNA和11个上调的miRNA。通过GEO芯片对miRNA进行验证,其表达水平与微阵列分析一致。差异基因包括20个下调的基因和32个上调的基因以用于GO注释和KEGG途径富集分析。富集分析结果表明差异基因在MAPK信号通路中显着富集。筛选mi R-133b-3p用于进一步进行具体的分子机制研究。Scn2b,TRPM8和Piezo2等33个基因被认为是mi R-133b-3p的靶基因。在功能验证测试中,mi R-133b-3p可以调节某些与神经性疼痛相关的基因的转录。结论:我们第一次构建了神经性疼痛中潜在的miRNA-mRNA调控网络。mi R-133b-3p可以调节某些与神经性疼痛相关的基因参与神经性疼痛。我们的发现揭示了miRNA-mRNA在神经性疼痛中的潜在作用。
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