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天山樱桃是第三纪末孑遗的珍贵古老树种,在我国仅分布于新疆伊犁地区和塔城地区。本研究以裕民县、特克斯、喀拉峻和大西沟4个野生居群的44株天山樱桃定点树为研究对象,通过对16个形态指标的变异分析、SSR和ISSR分子标记分析,从形态学和分子生物学两个层面揭示天山樱桃种质资源遗传多样性水平和遗传结构,以期为天山樱桃种质资源的保护与开发利用提供参考和理论依据。主要研究结果如下:1.通过对天山樱桃形态指标的测度,发现4个天山樱桃野生居群中喀拉峻居群表型多样性水平最低,裕民县居群表型多样性最丰富,大西沟居群次之。4个居群中不同形态指标的分化系数在3.74%~51.93%之间,平均25.77%;各形态指标中以花的形态指标遗传稳定性最好,而果实和种子的遗传稳定性相对较差。16个形态指标中果实纵径、果实横径、单果重、种核质量、雌蕊长、花瓣长和可溶性固形物含量是进行天山樱桃表型观测的重要指标。2.通过研究不同保存方法对天山樱桃叶片总DNA质量的影响,发现采取-70℃冷冻保存、室温保存、硅胶干燥保存和微波处理2min时叶片总DNA纯度较好;液氮保存和微波处理2min有利于总DNA浓度的提高;使用液氮保存叶片样品时,总DNA的完整性最好;当采用硅胶干燥、室温干燥和烘箱干燥的保存方法保存叶片样品时,所提取的DNA可以获得清晰可见的PCR扩增图谱。3.采用李属的14对SSR引物对天山樱桃进行遗传多样性分析。共扩增出191个位点,多态性位点百分率(PPI)为76.05%,有效等位基因数(Ne)为1.3939,Nei’s基因多样度(H)为0.2398和Shannon信息指数(I)为0.3676。大西沟居群遗传多样性水平相对较高,喀拉峻居群遗传多样性水平最低,居群内遗传分化高于居群间,基因交流主要存在于居群内。4.采用ISSR分子标记对天山樱桃进行遗传多样性分析。26条引物共扩增出236个位点,多态性位点百分率(PPI)为74.12%。Nei’s基因多样度指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.2073和0.3188,各居群间遗传分化系数(Gst)为0.2282,基因流(Nm)为1.6911,认为天山樱桃遗传分化水平较低,居群间基因交流频繁,遗传变异主要来源于居群内。基于遗传距离(GD)的聚类图可知,喀拉峻与大西沟居群遗传关系最近,与裕民县居群遗传距离(GD)较远,4个天山樱桃居群中大西沟居群遗传多样性水平较其它居群高。